总的来说就是朝廷的选官取士规则也要根据现实情况相结合，适时予以调整，朱载坖命令礼部根据这个意见制定相关的规定，将附籍和学籍等制度建立起来，同时要严厉打击的冒籍，因为现在冒籍的现象已经非常之猖獗了，而且形成了一定的规模，不仅西部省份存在冒籍现象，东部省份也有冒籍现象。
据礼部的奏报，在南方，由于福建文风颇盛，尤其是沿海各府县童试竞争激烈，而台湾新设府县县学生员名额较多，比较容易考取，因此许多福建的读书人往往找个台湾同姓的人，过继给他们，称他们为叔叔。伯伯，把自己的籍贯改为台湾，这是典型的冒籍行为。
而在北方，大宁、辽东等新设布政使司的科举考试相对比较容易，所以北方的办法就是想办法到辽东等地去参考，这里录取的概率更高，所以朱载坖的看法是要以录取率为准，礼部制定生员、举人的率取率，在统一录取率的办法下确定各布政使司的录取人数，相对的维护公平。
对于冒籍行为，要予以严厉打击，不论中式与否，都要严惩，同时还要将其参考资格予以革去，以保证朝廷开科取士的公平性。
除此之外，朱载坖关心就是现在案件的办理情况了，朱载坖召集三法司和厂卫长官，询问案件的办理情况，在朝廷采取的各种措施之下，已经有不少的官员主动投案自首，以换取朝廷的轻判，同时他们供出了大量的行贿商人和与他们一道受贿的官员们，三法司和厂卫根据这些线索抓捕了大量的官员和贿赂他们的商人。
杨继盛对于这些官员是十分之嫌弃的，连诏狱都扛不住，却有胆量受贿以千万计，尤其是关于朝廷赋税的这些实权衙门，如户部、海关、税务、盐政等衙门，即便是其中的吏员受贿数千元也是常见的，对于这些人，朱载坖的态度是很明确的，以法绳之，朝廷既然制定了律法，就应当依照律法行事。
不过朱载坖很清楚，这些不过是一些小鱼小虾罢了，真正的大头还没有来呢，朱载坖已经命令严世蕃详细审查京师的钱庄、票号、银行等的大宗会对业务，从中发现其中的疑点，严世蕃已经有了一些发现，一些沿海的大豪商，在京师只有一间铺面，并没有什么多的贸易，但是却向京师汇兑大量的银钱，这就引起了严世蕃的怀疑，厂卫已经重点监视这些豪商了。
朱载坖明确了这次打击的对象不仅仅是那些贪墨的官员，那些行贿官员，意图干涉朝廷决策的豪商更是朝廷重点打击的对象，朱载坖要求严世蕃和陆绎，将这些幕后的黑手给揪出来，将他们的绳之以法，朱载坖很清楚，对于朝廷来说这些豪商对于朝廷的危害是很大的，朱载坖这次要狠狠的给人长长记性，不要以为有钱了就可以随意伸手，有些东西不是他们能碰的。
朱载坖还命令各镇总兵和各都司的都指挥使，配合锦衣亲军的行动，要将这些人予以拿获。同时朱载坖还颁布诏书，敕令这些商人限期自首，否则的话，勿谓言之不预也！
随后朱载坖召见了王国光、庞尚鹏、梁梦龙、沈季文等人，商量对于工商赋税的问题，对于朝廷来说，现在这是最重要的事情，朝廷为了征收工商赋税，不惜大动干戈，朱载坖甚至掀起大狱，以保证工商赋税的征收。
朱载坖向这些重臣们询问有关工商赋税的制定问题，沈季文等人首先是总结了大明现在的商业赋税的弊端，大明先行的商税制度，主要有以下的弊端，第一是比例单一，太祖皇帝规定商税三十而取一，看似比较轻，但是这种一刀切的税率显然有很大的问题，一些奢侈品的利润往往高达数倍，这种商税显然是不够的，沈季文等人认为，要予以分门别类的设立商业赋税，对于酒、茶、奢侈品等利润高的要科以重税，对于粮食等货物要尽可能的不征税。
第二就是征收随意，这是现在大明商税最大的弊端，因为大明的商业税收，并没有一定之规，很多时候是否征收商税，以什么名目征收，征收多少，往往不在朝廷的控制之下，地方州县官府有很大的自主权，州县正印为了解决自身的财政问题，往往随意开征，导致商贾困顿，朝廷也并没有从中获得多大的好处。
王国光等人认为，应当将征收商税的权力上收到朝廷来，所有有关课税的事情，都必须由朝廷决定，不能任由地方官府随意征收，这点是非常之重要的，王国光就说道：“陛下，关市之征,宋元颇繁琐,本朝初务简约,其后增置渐多。行资居鬻,所过所止各有税。”
现在大明的商税，对于地方的小商人是沉重的负担，其征收的范围很广，几乎是无物不税，凡“田宅、头匹、店房、酒醋、布帛、各色商货”皆有所征，这是不正确的，朝廷征收商税的主要对象应该是豪商和价值较高的商品，同时要收地方之权，不再允许地方随意开征商税，所以赋税的开征与否，都要由朝廷决定。
这点得到了朱载坖的支持，朱载坖认为，税赋的征收大权，也是朝廷的基本权力，不能由地方随意决定，地方的财权过大，就容易产生割据势力，这点朱载坖是很清楚的，所以要强化朝廷的采取，抑制地方财权，以保证朝廷对于地方的控制。
第三就是征收的部门不统一，虽然朝廷设立了税务总署，将钞关等税收交给了税务总署，但是很多的赋税并不在税务总署的管辖范围内，如抽分税，抽分税就是在水陆要冲设局或场，进行竹木抽分，是对商人贩运的竹木进行的课税，因其由工部管辖，并差官抽分，故又称工关税。抽分税一般由工部派员在主要交通要道设立抽分竹木场，对商人所贩运的竹子、木材、薪炭等课以实物税。并不归税务总署管理。