朱载坖的诏书下达之后，并没有像朱载坖想象的那样引起广泛的讨论和争议，当然，主要也是这么多年以来，对于赋役折银这件事情，朝廷上下已经有很多的讨论了，张居正也是一直坚定的支持赋役折银的人，所以他担任首辅之后，推动赋役折银，大家并不感到奇怪。
而且现在大家的注意力都在东南的大案上，对于朝廷的这些措施到没有深入的了解，朱载坖也是瞄准了这个机会才果断推行一条鞭法和摊丁入亩，朱载坖和张居正很清楚，在平时，要想推动摊丁入亩是很难的，将会面临极大的阻力，因为按照之前的制度，徭役和杂泛差役有均徭银，丁有丁税银。由于土地集中于富人，继续按丁征收丁税，实际上是将这部分的赋税加到了贫苦的百姓身上。
而实施摊丁入亩之后，丁银实际上就被取消了，百姓个人只要是不再拥有土地的，就不再缴纳丁银，而将这部分的赋税转移了土地所有者的身上，实际上就是增加土地拥有的成本，变相的打击土地兼并，这在平时，肯定是要搞得整个东南沸反盈天的，这些士绅们不跳起来八丈高来怪呢。
但是现在朝廷在东南刚刚掀起大案，严厉打击了这些豪强士绅们，这个时候正是推动摊丁入亩的好时机，这些士绅们是决计不敢在这个时候和朝廷对着干的，所以这个时候正是朝廷推动大规模摊丁入亩的好时机。
不仅仅如此，应钦差浙直观察使严世蕃的奏请，朱载坖还批准了对于苏松等地纺织业征收赋税的奏疏，根据严世蕃的奏请，对于苏松等地的纺织业，织机超过三张的，每张每年征收三两银子，棉布每匹征收三分银，丝绸根据品质的不同，每匹征收八钱到一两五钱。
现在苏松等地的棉纺织业异常发达，各种海上贸易也非常之兴盛，所以严世蕃还奏请对于关税进行重新修订，朱载坖命令户部会同海关总署衙门，重新拟定关税细则，主要是对于奢侈品加征高额关税，尤其是什么龙涎香、海马等西洋的名贵药材，要科以重税，而对于大明大量出口的瓷器、茶叶、丝绸布匹等，也要细化征收赋税的条例，增加海关关税的规模。
而且要增加禁榷物资种类，不仅仅有限制出口的禁榷物资，还有由朝廷禁榷进口的物资，主要是一些南洋、西洋的药材，经翰林医官院判李时珍的奏请，将治疗疟疾的特效药物金鸡纳霜予以禁榷，所有的金鸡纳霜由朝廷予以收购，同时朱载坖还发布悬赏，能够获取金鸡纳树或者种子来献的，朱载坖赏银五千，给官百户。
因为现在佛郎机人在爪哇岛上种植金鸡纳树，但是他们想要将种植金鸡纳树事业垄断起来，严厉控制金鸡纳树的种子外流，使得大明只能以高价从佛郎机人那里购买，而金鸡纳霜又是治疗疟疾的特效药，有了金鸡纳霜，大明在缅甸的移民才能够顺利开展，所以朱载坖不惜以悬赏求购金鸡纳树的种子，要获取金鸡纳霜。
严世蕃在奏疏中向朱载坖详细介绍了东南现在的情况，虽然苏州仍旧是东南最繁华的城市，但是现在松江府，尤其是上海州也已经成为后起之秀了，作为大明在东南开放的重要口岸，上海州是大明的丝绸、布匹、茶叶、瓷器的重要出口港，大量的货物每年从这里运往各地。
从南洋、西洋来的各种货物也通过上海运往大明各地，上海的重要性可见一斑，严世蕃奏请朱载坖重视上海，将上海从松江府的散州升格为直隶州，加强朝廷对于上海的控制，朱载坖同意了严世蕃的建议，在和吏部和户部商量之后，下诏升上海为直隶州，下辖上海县，同时将原松江市舶司改称上海市舶司，原松江海关自然也改称上海海关。
而顺天巡抚申时行的一份奏疏则是引起了朱载坖的注意，申时行主动向朝廷奏请，在北直隶施行一条鞭法和摊丁入亩，这是朱载坖所没有想到了，在朱载坖和张居正的计划中，赋役新政的推行是以东南为试点，然后向南北推广，北直隶实际上应该是相对比较靠后的地方，毕竟北直隶是大明的腹心之地，肯定是要以稳定为主，而且说个实话，北直的赋税并不多，不管是改折还是其他的办法，也不会有太大的变化。
但是申时行在奏疏中也说明了自己的理由，申时行认为，对于北直隶来说，田赋并不是北直隶百姓最可怕的事情，朝廷在北直隶征收的田赋还是相对比较少的，真正令北直隶百姓痛苦的事各种无休无止的差役，因为北直隶不仅仅要承担本省以及各府州县的杂泛差役，还有承担整个朝廷六部各衙门和宫廷杂泛差役，这才是北直隶百姓最痛苦的。
申时行在奏疏中列举了北直隶要承担的各种差役，不仅仅是为京师各衙门提供人力，还要为朝廷、皇室各衙门提供各种所需要的物资，最简单的就是冬季取暖所用的木炭，每年采办木柴四千二百余万斤，木炭九百又四万斤，这还仅仅是其中的一项，北直隶百姓还要负责北直隶的漕渠通畅，甚至有些时候要帮助朝廷疏浚漕渠，要求大量衙门所需要的物资，都是直接由北直隶承办的。
所以申时行上奏请求在北直隶推行一条鞭法，将北直的各种杂泛差役予以核算，平摊下来，将北直的老百姓从这种繁重的徭役中解脱出来，而朝廷则可以用均徭银直接召商购买，同时雇佣百姓从事各种工程营建。
还有就是马政，这也是对于北直隶百姓来说最痛苦的东西，申时行向朝廷上疏，请求朝廷能够减免一些北直隶的马政负担，现在朝廷暂时不会用兵，可以让百姓休养一段时间，所以申时行奏请在北直隶率先推行一条鞭法和摊丁入亩。