韦小宝踏入京城，往昔熟悉的喧嚣瞬间将他裹挟。街头巷尾，小贩叫卖声此起彼伏，可他无心留恋，径直朝着皇宫赶去。进宫途中，那些侍卫、太监们投来的目光复杂难辨，有敬畏，似忌惮他过往功绩与皇上恩宠；亦有嫉妒，仿若不满这草根出身之人平步青云。
康熙在御书房单独召见了他。踏入那扇门，屋内静谧得仿若能听见尘埃飘落，康熙高坐龙椅之上，目光如炬，将韦小宝上下打量一番，旋即露出欣慰笑容：“小桂子，数月不见，瞧着沉稳不少，少林寺果真没白去。”韦小宝赶忙跪地请安，言辞恳切：“皇上洪福齐天，奴才在寺中日夜苦练，就盼着回来能再为皇上分忧。”君臣二人寒暄几句，康熙话锋一转，提及朝堂局势。原来，韦小宝离京这些时日，朝内党争暗潮汹涌，以索额图和明珠为首的两派势力明争暗斗，皆欲扩充自家权势，诸多政令推行受阻，朝廷上下乌烟瘴气。
韦小宝心中暗忖，这局面棘手至极，仿若置身荆棘丛，稍有不慎便会被刺得遍体鳞伤。康熙却似早有定计，目光笃定地望向他：“朕命你暗中查探，寻出两党争斗实证，朕要肃清这朝堂歪风，还天下清明。”韦小宝领命，深知此乃关乎江山社稷安危之举，丝毫不敢懈怠。
此后日子，韦小宝仿若暗夜幽灵，穿梭于京城权贵府邸间。他凭借往昔练就的玲珑心思与机灵手段，今日扮作小厮混入索府，偷听得几句机要秘谈；明日又佯装醉酒宾客，于明珠家宴上套取关键信件。然而，危险仿若附骨之蛆，紧追不舍。一日，他从索额图书房窃取账目副本后翻墙而出，不料暗处蹿出数名黑衣杀手，刀光剑影瞬间将他笼罩。韦小宝身形一闪，抽出匕首，凭借少林寺所学精妙身法周旋，险象环生之际，好在有江湖旧识路过援手，才得以脱身。
历经月余，韦小宝终于集齐关键证据，呈至康熙面前。朝堂之上，康熙雷霆震怒，当堂将索额图、明珠二人及其党羽罪行一一揭露，撤职查办者众多，朝堂仿若经历一场狂风暴雨洗礼，一时人人自危，却也重归清正。
风波暂歇，韦小宝未及喘息，康熙又召他入宫。御书房内，气氛凝重，康熙神色凝重地递给他一份密函：“小桂子，朕接获密报，台湾局势危急，郑克塽那厮妄图勾结西洋势力，将宝岛拱手相送。朕命你即刻启程，以钦差身份赴台，或招安，或智取，定要保我大清海疆安宁，台湾重回版图。此去艰难，万事小心。”韦小宝接过密函，心中知晓这任务仿若千斤重担，却毫不犹豫叩头领命。
筹备数日后，韦小宝率一众亲信及水师精锐扬帆出海。航行途中，狂风巨浪仿若癫狂巨兽，不断拍击船身，舰队飘摇不定。更有海盗船闻风而动，如恶狼环伺。韦小宝站在船头，高声呼喝指挥，凭借海战经验与果敢决断，或炮击，或火攻，一次次击退海盗侵袭。
待靠近台湾海域，上岸后所见皆是民生凋敝之景，百姓受战乱纷扰，苦不堪言。韦小宝深知，若一味强攻，受苦的终归是无辜百姓。他决定孤身犯险，乔装潜入郑克塽居所，欲晓以大义劝其归降。那夜，月黑风高，韦小宝避开重重守卫，潜入内室，郑克塽见他竟如天降神兵，惊愕之余拔刀相向。韦小宝镇定自若，将大清宽厚招安之策、两岸同根同源之理娓娓道来，言辞恳切，直击要害。郑克塽面露犹豫之色，心中权衡利弊，久久未语。
经多番交涉，郑克塽终被韦小宝赤诚之心与大清诚意打动，同意归降。台湾光复喜讯传至京城，康熙龙颜大悦，朝堂欢庆。韦小宝乘船凯旋而归，码头上百姓夹道欢呼，鲜花锦缎抛洒漫天，仿若迎接凯旋英雄。
可韦小宝站在船头，望着这热闹场景，心中却泛起别样涟漪。历经无数生死、权谋争斗，他已身心俱疲。回朝受封当日，金銮殿上文武百官齐贺，康熙欲封他高位，享无尽荣华。韦小宝却跪地叩首，言辞坚决：“皇上，奴才一介草民，蒙皇上厚爱才有今日。但这些年风雨漂泊，奴才心累神乏，只望余生能寻个清净地方，逍遥度日。望皇上成全。”康熙凝视他良久，似看透其心思，长叹一声：“既如此，朕准你所求。”
此后，韦小宝便如人间蒸发，江湖传言四起。有人说他携家眷去了鹿鼎山，那藏着无尽宝藏之地，欲守着财富安稳余生；有传言他心怀愧疚，前往五台山，在青灯古佛旁忏悔过往杀戮与权谋手段；亦有传言他奉密旨，再度远赴海外，去督办那些关乎大清国运、鲜为人知的机密大事……
岁月悠悠流转，韦小宝之名渐渐隐没于历史长河，只留下几段传奇故事，在街头巷尾、茶馆酒肆被人偶尔提及，成为百姓们茶余饭后的一抹遐想，而那段波澜壮阔的岁月，仿若泛黄书页，被静静尘封，待后人偶然翻开，依旧能窥得几分往昔风云。本小说到此结束。