对于西北的水利，不仅仅是要修建，更加重要的是要维护和使用，由于西北的特殊的地理气候和一些其他的原因，对于大明来说，西北是一个很特殊的地方，西番、蒙古等少数民族交错分布，所以朝廷站在这里配置了大量的卫所，同时这些民风剽悍，也是容易引发民变，这些问题，也都是朝廷要考虑的。
兵部尚书梁梦龙等人都是在西北待过的，对于这些事情还是比较了解的，郑洛等人就此事也上疏朱载坖，西北的渠道在使用数年后，常出现淤塞崩塌，引水不利，导致农业减产，朝廷不但要拨款负责这些水利工程的建设，更重要的还有这些水利工程的维护和使用，这点也是非常之重要的。
西北由于普遍的干旱缺水，导致对于水源的争夺和因此产生的各种官司都是极为频繁的，朝廷在西北建设水利设施，不仅仅是要建设，更加重要的就是管理和维护，这点是最重要的，之前朝廷也不是没有在西北兴修过水利，但是效果并不好，原因其实是非常之简单的，就是朝廷所兴修的这些水利设施，他们的收益都被当地的豪强势力所霸占了，百姓并没有从朝廷所兴修的这些水利设施中收益，这点是最为关键的。
郑洛就在给朱载坖的奏疏中说道：“河西十五卫、东起庄浪，西抵肃州，绵延几二千里，所资水利，多夺于豪势之家。水利之弊，贫者卖日，富者专利，及强若义拜，信哉斯言乎！邑中贫，近可征。征诸东西，鬻田临封，即泉磨二渠，属我邑者仅十三四耳。名曰寄庄，税役既重，在我催征，又累在甲，愚民或悦。膻而吓腐，不虞其蚕渔也。亦曰研三尺以禁巧售之奸耳！”
对于这个问题，也是朱载坖很担心的问题，因为西北除了河西走廊和河套之外，其他的地方都是十分缺水的，所以郑洛认为，对于这些地方来说，除了要兴修水利之外，更加重要的对于这些水的分配，朝廷必须要保证这些水利工程能够尽可能的为百姓所用，之前朝廷也不是没有在西北兴修水利，但是效果都不是很好，重要的原因就是这些兴修的水利根本没有为百姓所用。
当地的豪强们倚仗自己在当地的特权，垄断了这些本来是朝廷修建的水利设施，用以浇灌自己的土地，同时现在大明的水利设施引水方式一般分有坝引水和无坝引水。有坝引水一般设置在河流径流量小、河流水位不能满足无坝自流引水时，通过设置坝体，拦蓄更多水量。
而有坝引水一是所引河流流量不如无坝引水，且一旦上游拦水，地方会发生纷争；二是工程量比无坝引水大。在西北这种争水的事情是更加频繁，由于西北民风彪悍，加以此地的水源对于农业生产的影响是极大的，在这种情况之下，因此而产生的各种案件都使得地方州县州府极为痛苦了。
这点确实是西北现在的现状，朝中的一些西北籍的官员们也纷纷上疏阐述西北的实际情况，对于西北来说，由于本身就十分贫瘠，所以再征发百姓来修建各种水利工程，对于百姓来说是极为沉重的负担，这点朱载坖也很清楚的。
大理寺卿孙丕扬就上疏称：“渠堰未通，科征如故。民日疲而徭日倍，地益削而赋日加，以百五十里之地而达官贵人以千计。乃一人耕而食数人。人引水灌田，修渠垒坝，煞费工本，己嚣然丧其乐生之心。矧起科太重，征求无己，较诸他省之粮差更未有烦重于此者，尚可以修屯政乎？甚矣！”
对于西北的现实情况，朱载坖也是要做一些准备的，朱载坖首先命令陕西、甘肃、宁夏、山西等布政使司以及下辖各州县，首先查照自己辖区的水利设施状况和灌溉面积，还有就是这些水利设施的利用情况，都是朝廷要了解的情况的。而对于西北的水利和田土情况，最主要的就是军屯与民田之间的争端，还有就是卫所军官对于水利资源的垄断，这些都是西北最大的矛盾。
西北由于边防压力沉重，朝廷在西北设立了众多的卫所，用于防备北虏、西番，而在设立这些卫所的时候，由于当时的地方人烟稀少，百姓逃亡，所以这些地方的好田都被卫所占有耕种了，这就导致在西北很多时候膏腴之土，尽属卫所，而百姓所有，皆是薄田的情况，就此事，卫所士卒和百姓，都司卫所和地方官府之间的矛盾是很深的。
这点朱载坖是很清楚的，除此之外就是卫所军官们对于水的垄断，这些在官员们的奏疏中是很明显的，官员在奏疏中经常弹劾这些卫所军官们：“广买庄田，私役屯军，改挑渠道，专擅水利。又纵下人占种膏腴屯田，是致军士怨嗟，兵政废弛。”
同时这些卫所军官们利用职权，将有利于浇灌的土地变为自己的庄田，同时控制河道，使得朝廷的军屯和百姓的土地得不到浇灌，最后的结果就是大量的军屯和百姓土地由于得不到浇灌而没有收成，而朝廷的赋税确实实实在在存在的，在这种情况之下，屯军百姓的大量逃亡也是不足为奇了。
所以孙丕扬等人上疏称：“甘肃孤悬，无飞挽之利，无市籴之便，屯田为急。如庄浪之属郎堡、通远驿，永昌水磨川，甘州之左卫迤西，镇东之东南诸湖，肃州之临水等堡，兰州之东西二川。沃壤丘垄现存，河渠故道犹在。申饬镇巡，责成属官，务兴屯利。葺墩塞以居，通渠坝以灌。召富家商贾，以垦为己业。并不许军屯攀扯，官府搜求。庶甘肃之屯利大兴。”
他们认为要重振河西的农业，重点还是要排除卫所的干扰才行，他们主张实施商屯，而不是恢复军屯。