因为之前在朝廷所制定的工商赋税草案中，将各种的契税统一规定为印花税，印花税是对在经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证的行为征收的一种税。其因采用在应税凭证上粘贴印花税票作为完税的标志而得名。商人们认为，朝廷也太锱铢必较了，连商人之间订立合约这样的事情也要征税，未免征收的过于宽泛和细微了一些。
对于印花税，朝廷上下也确实是有很多的非议，也有不少官员认为印花税可能收到的钱并不多，但是却很影响朝廷的形象，对于这点，朱翊釴也向朱载坖做了奏报，不过朱载坖对于此事却并没有予以答应，朱载坖认为，印花税是绝对要征收的，首先，这不是一笔小钱，不要看着印花税的税率不高，但是实际上，由于各种经济活动的频繁，印花税的征收次数是非常之多的，积少成多，这笔赋税也是很可观的。
其次就是印花税不仅仅是一笔税款，也是朝廷了解经济运行的一个途径，通过印花税的征收和统计，朝廷得以了解各种经济活动的情况。
最重要的是这也是朝廷和这些商人的契约，商人之间签订各种合约，各种资产的转让，都需要到朝廷来备案，并且缴纳印花税，而通过印花税的缴纳，使得朝廷对于这些契约和资产的转让的合法性予以保护，无论是各级的地方官府还是法司衙门，都要保护这些合法的契约，缴税自然是应当的，否则朝廷为什么要保护这些商人的利益？
不缴印花税，是准备白嫖朱载坖吗？所以印花税必须要征收，虽然印花税的税率不高，在整个大明的赋税中所占的比例也不大，但是通过印花税，可以了解大明经济运行的相关情况，同时带动其他赋税的征收，所以印花税是极为重要的，坚决不能放弃。
在朱载坖的坚持之下，朝廷对于这份工商赋税草案和相关的赋税管理制度进行了一些调整之后，经过廷议予以通过，朱载坖也随即签发上谕，昭告天下，自隆庆二十四年起予以实施，同时将征税的权力上收到朝廷，任何新赋税的设立和征收，都必须经过朝廷的同意才行，地方各级官府都无权新增赋税，凡是在朝廷所规定的赋税种类、名目、税率之外的，都可以立即向巡按御史或者提刑按察使司、督抚、税务总署分司等衙门举报甚至直接进行京控，各相关衙门接报之后，必须立即处理并且上奏朝廷，查明情况。
在朱载坖颁布工商赋税则例和税务则例之后，朱载坖命令对于税务总署进行调整，升格为正二品衙门，以户部尚书提督，直接对朝廷负责，同时将各钞关、课税司局等和征税有关的官署，一律转隶税务总署，由税务总署进行管理。各税务总署分司也都加户部右侍郎衔，督理各处粮饷。
在朱载坖对于朝廷的税务工作进行整顿之后，文思院也传来了好消息，在朱载堉和一众工匠的努力之下，终于制造出了第一台由实际价值的蒸汽机，之所以说他是有实际价值，就是因为这种蒸汽机终于有了曲轴连杆装置，有了这个装置，活塞的往复运动就可以转变为曲轴的旋转运动，同时将作用于活塞上的力转变为曲轴对外输出的转矩，这就使得蒸汽机可以使用了。
有了这个机构，蒸汽机的作用就不止于抽水了，军器监的镗床、钻床，甚至是船厂切割木材等等，都可以使用蒸汽机了，并且这样的蒸汽机也就具备了实际的功能，对于朱载坖来说，是十分振奋的一件事情。
朱载坖和太子，还有内阁辅臣，六部尚书、参赞军务大臣们一道前往文思院查看，这个蒸汽机，重臣们原本对于朱载坖的这般重视都有些不能理解，文思院作为大明的科研机构，确实发明了非常多的机械，对于大明来说也确实有很大的帮助，但是朱载坖这般重视，还是很少见的，这么多的重臣们都被朱载坖叫来了，可见朱载坖对于此事的重视程度。
朱载坖到了文思院之后，朱载堉已经将相关的设备准备好了，朱载坖命令启动，在煤炭的燃烧之后，蒸汽机被启动了，由于现在的蒸汽机功率还实在是太小，所以朱载堉给蒸汽机连接的是一台给官军手榴弹木柄转孔的机器，在蒸汽机启动之后，钻头飞速的旋转起来，而手榴弹的木柄很快就被钻好了，其速度之快，都超过了重臣们的想象。
朱载堉向朱载坖和随行的重臣们介绍道，现在的蒸汽机还只能带动一些较小的机器，但是和人力相比，已经是划时代的优势了，机器不止疲倦，就以给手榴弹钻孔这个工序来说，蒸汽机可以抵得上数十名工人，这是之前所不敢想象的。
当然，现在的蒸汽机确实存在很多的缺点，功率不够大，机器十分的笨重，同时锅炉存在爆炸的风险，但是朱载堉认为，他胜过人力畜力不止百倍，假以时日能够成为大明制造各种军器、装备的利器，朱载坖对于文思院的成果十分满意，决定兑现诺言，给在研制蒸汽机过程中有功的工匠、传教士们封官赏银，同时命令文思院继续研制蒸汽机，使其能够使用。
同时对于在进行实验过程中死亡、受伤的工匠，也都要予以抚恤，重臣也当然知道这种机器的作用，假以时日的话，可以完全取代人力和畜力，对于大明来说绝对是一件了不起的事情，同时现在还是要严守秘密，朱载坖将朱载堉教导一边来，要求对于参与研制蒸汽机的传教士要加强监视，同时锦衣亲军也要介入，防止他们向西洋泄露相关的消息，朱载堉当然是清楚此事的重要性，所以赶紧答应下来。
朱载坖这才回到西苑去。