对于朱载坖的命令，李成梁自然是立即接受并且执行的，除此之外，朱载坖还召见了兵部右侍郎提督测绘署事叶春及，这些年以来，在朱载坖的支持之下，测绘署对于大明的各个府州县进行了详细的测绘，绘制了相对精确的地图，对于官军和朝廷的行动起了极大的帮助，朱载坖认为现在大明仍旧要重点做好地图的测绘工作，在很长一段时间内，测绘地图都是大明很重要的事情。
尤其是对于大明新收复的这些领土，更要加强测绘，朱载坖决定加大对于测绘的重视程度，将测绘署升格为测绘总署，同时加大对于测绘学堂的支持，培养测绘人才，现在重点是对于西北、蒙古的地图测绘，朱载坖已经下旨给顺义王乐，要求顺义王和土默特部配合大明测绘草原地图，为日后大明用兵于草原提供可靠的地图支撑。
除此之外，对于现有地图，也要及时予以勘误，地图对于大明是极为重要的，务必要保证精确，否则是要招致大败的，除此之外，测绘总署还有一个重要的职能，就是收集各国的地图，同时甚至是要配合尽一切的密探潜入他国，测绘地图，为大明所用，好在现在其他国家对于地图并没有那么重视，这个任务的难度没有那么大，而且主要也是针对大明的各个藩属国，所以还是相对比较安全的。
朱载坖随后给顺义王下旨，主要是提到几件事情，第一是在大明的强力推动下，乌斯藏也已经接受了大明的金瓶掣签制度，朱载坖命令顺义王派遣使者，和大明理藩院、三边总制等相关衙门一道见证新活佛的选出。
第二就是扩大大明对于土默特部牛羊马匹、皮裘、毛纺织品等采购，因为大明要经略东北，而在寒冷的东北，如辽东、吉林等地，仅靠棉衣是无法御寒的，皮裘和毛纺织品显然是更好的选择，同时蒙古草原所出产的大量牛羊，也可以为大明官军提供必要的肉食，加强大明和土默特部的联系。
第三点就是在顺义王的配合下，朝廷准备对于蒙古的矿产资源进行调查，如果有可供开采的矿冶，蒙古的贵族们也会从中受益的，朝廷会和蒙古贵族们一道开采这些矿产，分配利润给这些蒙古大小贵族，当然前提条件是大明的测绘人员和找矿人员能够进入蒙古。
第四点就是朝廷准备征讨瓦剌，需要当年追随俺答汗一同征讨过瓦剌的老兵为大明提供瓦剌的相关情况，同时帮助大明收服这些蒙古部落。
朱载坖对于土默特部，一向是相对比较宽容的，大明的政策就是支持顺义王在蒙古部落中的地位，同时加强和土默特部的经济联系，使得蒙古上下在和大明的经济交往中获益，对于土默特部，朱载坖认为现在还是比较恭顺的，而且在三娘子的辅佐之下，不他失礼也有较强的威望，这点是大明所乐见。
在朱载坖和内阁以及大将们详细讨论了此事过后，朱载坖还是定下了基调，就是加强对于西域的经略，以哈密卫的攻击出发阵地，充分利用西域的地形特点，经略西域，西域的地形特点是山地和盆地交错配置，北面是阿尔泰山，南面是昆仑山，天山横亘中部，对于整个西域来说，天山无疑是最为重要的。
天山不仅从地理上将西域分为两个相对独立地理区，天山的冰纯融水更是西域的生命之源，天山山麓扇形地或山前倾斜平原主要分布在天山山地南北山麓地带，由众多的大小河流出山谷后堆积的扇形体连接而成。这些地段大多为绿洲之所在，朝廷可以利用这些绿洲开垦屯田，设兵驻防，控制整个西域。
天山的草原也是瓦剌等游牧民族赖以生存的地方，天山的山地草原从高山到山麓分为高山荒漠草原、亚高山草甸草原、森林草原、中低山干草原—半荒漠草原、山麓荒漠草原等。高山荒漠草原的牧草生长期很短，利用价值很低，为盛夏短期牧场。山麓荒漠草原比较缺水，利用价值也低。山地草原垂直分布范围大，牧草优良，生长茂密，产量稳定，可发展多种牧畜。
同时在具体的战术实施上，朱载坖主张在充分的准备之后，先北后南，缓进急战，以哈密为官军的集结地，先夺取天山以北，和伊犁河谷地，作为官军的后勤补给地，这也是经过历史考验的战术，北疆土沃物阜，可供驻军及作为军储基地，保障物资供应。从历史经验看，北八城广，南八城狭，北可制南，南不能制北，所以必须先北后南。
而缓进急战，则是对于战场节奏的把握，西域广大荒凉，官军的后勤补给是困难的，朝廷要想长期维持重兵在西域，所耗费的钱粮也是十分惊人的，朱载坖当然做好了投入大量人力物力的准备，但是同样的，朱载坖也要要求李成梁等大将尽可能的减少损耗。
所谓的缓进急战，关键在于速战速决，不可松弛懈怠，犹豫不决。战机稍纵即逝，一旦错过打击的最佳时机，则可能陷入腹背受敌、进退失据的境地。兵贵神速，一方面要求在急战之前必须做好一切准备；另一方面，出兵进击要达到“稳、准、狠”的打击效果。这这是李成梁所擅长的，官军主要以精骑快速突击，意在以快打快，通过一系列的突击达到对于西域各部，尤其是瓦剌的有生力量的削弱和对于关键绿洲的控制。
所以朱载坖认为，战前的准备是极其重要的，所幸主动权现在在朝廷手中，要把有限的精力投入到关涉战争成败的关键方面，将大量的时间和精力投入到战争需要的兵、饷、粮、运等核心要素，扎扎实实做好物资储备和军需供应。积极整军备战，不匆忙出击，练兵选将，等待命令。