宋代清和县外的龙隐山笼罩在浓雾中，潮湿的山风裹挟着泥土与腐叶的气息，吹得林间枝桠作响。狄仁杰与宋慈带领十名精锐捕快，循着盗墓团伙交代的路线向溶洞进发，腰间的跨世界联络器不时传来联盟总部的信号提示。
“大人，前方就是溶洞入口。” 捕快队长指着一处被藤蔓遮掩的石壁，石壁上隐约可见人工开凿的痕迹，“洞口有新鲜脚印，似乎刚有人经过。”
宋慈俯身检查，指尖抚过湿润的泥土：“脚印深浅不一，其中三人负重较重，应该是携带了工具。看泥土湿度，离开不超过半个时辰。” 他取出特制的追踪粉撒在地上，粉色粉末立刻沿着脚印延伸的方向亮起微光，“这是奇幻世界的追踪魔法，能持续六个时辰，跟着它走不会迷路。”
众人小心翼翼进入溶洞，洞内昏暗潮湿，钟乳石的尖端不断滴落水珠，在地面汇成浅浅的水洼。走至深处，前方突然传来金属碰撞声与低沉的交谈声。狄仁杰抬手示意众人隐蔽，自己则与宋慈贴着石壁缓缓靠近，透过钟乳石的缝隙望去 —— 三名身着黑衣的男子正用工具撬动一块巨大的岩石，岩石下方隐约可见一个暗格，暗格中散发着淡淡的青色光晕。
“动作快点，‘鬼手’大人说了，必须在日落前取走镇魂石。” 领头的黑衣人压低声音，手腕上的暗影图腾在微弱的光线下一闪而过。
宋慈眼神一凛，转头对狄仁杰比了个手势。狄仁杰会意，猛地起身大喝：“朝廷办案，尔等束手就擒！” 捕快们立刻围了上去，黑衣人身形矫健，抽出腰间短刀反抗，溶洞内顿时刀光剑影。
宋慈避开迎面而来的刀锋，指尖弹出一枚麻醉针，正中一名黑衣人的脖颈。另一名黑衣人见状，突然从怀中掏出一个黑色令牌，狠狠砸向地面。令牌碎裂的瞬间，一团黑雾喷涌而出，洞内能见度骤降。“撤！” 领头的黑衣人喊道，三人借着黑雾掩护向溶洞深处逃窜。
“别让他们跑了！” 狄仁杰挥剑劈开黑雾，却发现黑衣人已消失在岔路口。宋慈检查暗格，发现里面的镇魂石已然不见，只留下一道淡淡的黑色能量残留。“他们带走了镇魂石！” 宋慈取出能量检测仪，仪器屏幕上显示出强烈的暗影能量波动，“这波动正在向东北方向移动，应该是通往跨世界通道的方向。”
与此同时，未来世界的废弃工业区内，秦明与三澄美琴身着防化服，小心翼翼地潜入一栋破败的厂房。厂房外布满监控摄像头，地面散落着废弃的化学试剂瓶，空气中弥漫着刺鼻的异味。“柯南的定位显示，药物研发基地就在地下一层。” 秦明指着厂房中央的电梯井，“电梯已经损坏，只能走楼梯。”
两人沿着布满铁锈的楼梯下行，刚抵达地下一层，就听到实验室传来机器运转的声音。透过观察窗，他们看到几名穿着白大褂的研究员正在操作仪器，实验台上摆放着装有紫色液体的试管，试管壁上印着暗影图腾。“那些应该就是控制人的药物。” 三澄美琴拿出微型相机拍摄取证，“根据联盟数据库的资料，这种药物能让人失去自主意识，完全服从指令。”
秦明取出便携式检测设备，对准实验室的通风口：“药物成分正在分析中，初步检测出含有暗影界特有的能量粒子。” 就在这时，实验室的警报突然响起，红色警示灯瞬间亮起。“不好，被发现了！” 三澄美琴拉着秦明躲到墙角，几名手持电击枪的守卫冲了进来。
“我们是跨世界刑侦联盟的成员，奉命调查非法药物研发！” 秦明亮出联盟徽章，守卫却毫无反应，径直发起攻击。两人奋力抵抗，秦明用防化服的头盔挡住电击枪的攻击，三澄美琴则趁机打翻旁边的试剂架，紫色液体流淌一地，发出滋滋的腐蚀声，暂时阻挡了守卫的追击。
“必须毁掉数据库！” 秦明指向实验室中央的服务器，“里面应该存储着药物配方和卧底名单。” 两人默契配合，三澄美琴吸引守卫注意力，秦明则冲到服务器前，将随身携带的病毒 U 盘插入接口。“数据正在销毁中，需要三分钟。” 秦明盯着屏幕上的进度条，心跳不断加快。
现实世界的审讯室内，姚学琛与方木正对卧底 “夜枭” 进行深度审讯。“夜枭” 低着头，双手微微颤抖，脸上满是挣扎。“我们已经查到，你的家人被幽影盟囚禁在暗影界边缘。” 姚学琛拿出一张照片，照片上是 “夜枭” 的妻子和女儿，“联盟已经制定了营救计划，只要你配合我们，就能救回你的家人。”
方木补充道：“根据心理侧写，你并非自愿加入幽影盟，只是被胁迫。现在联盟已经掌握了暗影界的部分信息，只要找到完整的青瓷瓶，就能打开通道营救她们。”
“夜枭” 猛地抬起头，眼中含泪：“我知道‘鬼手’的真实身份线索！” 他深吸一口气，缓缓说道，“‘鬼手’的左手有一道月牙形的伤疤，而且他对宋代青瓷有着极高的研究，几年前曾以文物商人的身份出现在京都。另外，幽影盟的核心计划叫做‘暗影降临’，他们要在跨世界能量交汇日当天，用镇魂石和完整青瓷瓶打开暗影界的大门，让暗影能量吞噬所有世界。”
就在这时，审讯室的灯光突然闪烁，监控屏幕瞬间黑屏。“不好，是暗影能量干扰！” 姚学琛立刻按下紧急按钮，门外的警员迅速冲了进来。“夜枭” 突然脸色惨白，捂着胸口倒在地上，嘴角溢出黑色的血液。“他体内的控制药物发作了！” 方木蹲下身检查，发现 “夜枭” 的脉搏越来越微弱。
联盟总部的虚拟空间内，各世界的紧急信号同时响起。夏天看着屏幕上的警报信息，脸色凝重：“宋代龙隐山镇魂石被劫，未来世界研发基地遇袭，现实世界审讯室遭暗影能量干扰，‘夜枭’危在旦夕。幽影盟正在全面反击！”
柯南的虚拟影像突然闪烁：“数据库检测到大量暗影能量波动，跨世界通道的稳定性正在下降，部分通道已经暂时关闭！” 林越也发来消息：“奇幻世界的古籍记载，暗影能量突然爆发，可能意味着幽影盟已经开始启动‘暗影降临’的前期准备。”
夏天立刻启动紧急预案：“所有人听令！狄仁杰、宋慈继续追踪镇魂石的能量波动，务必在跨世界通道关闭前截回镇魂石；秦明、三澄美琴尽快完成数据销毁，撤离未来世界研发基地；姚学琛、方木立刻将‘夜枭’送往秦明的实验室，尝试解读药物成分，挽救他的生命；柯南负责修复跨世界通道的信号，确保联络畅通；我带领现实世界警方，加强各联络点的安保，防止幽影盟进一步袭击！”
指令下达后，各成员立刻行动。审讯室外，救护车呼啸而去；龙隐山的追踪仍在继续，暗影能量的波动越来越强烈；未来世界的实验室里，数据销毁进度已经达到百分之八十，守卫的攻击却越来越猛烈。跨世界刑侦联盟的首次协同作战，在幽影盟的突然反击中陷入了危机，而镇魂石的下落、“夜枭” 的生死、完整青瓷瓶的踪迹，都成为了决定这场跨世较量走向的关键。