回到基地后，林宇和神秘舰队的成员们没有丝毫的迟疑，立刻全身心地投入到对典籍的研究中。他们废寝忘食，日夜不停地翻阅着那古老而厚重的书页，仿佛这些书页中隐藏着宇宙的奥秘一般。
每一页的文字都如同迷宫中的线索，需要他们仔细地解读和拼凑。他们在图书馆的角落里，在研究室的灯光下，甚至在食堂的餐桌上，都能看到他们埋头苦读的身影。
然而，随着研究的深入，他们渐渐发现，这个邪恶组织的阴谋远比他们想象的更为可怕。原本，他们以为这个组织只是想通过获取典籍中的力量来增强自己的实力，但现在看来，这仅仅是他们计划的一部分。
经过一番艰苦的探索和分析，他们终于揭开了这个阴谋的全貌：这个邪恶组织的真正目的，是要利用这些典籍中的力量，打开多元宇宙通道，引入其他宇宙的恐怖存在。这些存在可能拥有超乎想象的力量和能力，一旦进入本宇宙，后果将不堪设想。
这个惊人的发现让林宇和神秘舰队的成员们都感到不寒而栗。他们意识到，自己所面临的不仅仅是一个普通的邪恶组织，而是一个可能导致整个宇宙毁灭的巨大威胁。他们意识到，时间紧迫，必须尽快找到应对之策，否则后果不堪设想。
就在他们加紧研究的时候，邪恶组织却突然发动了新一轮的攻击。这一次，他们显然有备而来，不仅提前破解了部分典籍的秘密，还派出了一种能够免疫特殊能量波的新型战舰。
面对这种新型战舰，联合舰队和神秘舰队的常规武器几乎失去了作用。双方陷入了一场激烈的苦战，损失不断增加。
林宇心急如焚，他深知如果不能迅速扭转战局，他们将面临灭顶之灾。就在他苦思冥想之际，突然，他从典籍中的一段文字中得到了灵感。
林宇立刻召集了所有的科学家和技术人员，共同商讨如何利用基地的大型能量发生器来制造一种能够扰乱多元宇宙通道的波动。经过一番紧张的研究和试验，他们终于成功地制造出了这种波动。
当这种波动被释放出去后，果然对多元宇宙通道产生了干扰，使得邪恶组织的计划暂时受挫。然而，这只是一个暂时的胜利，林宇知道，他们还需要更多的时间和努力，才能彻底阻止邪恶组织的阴谋。在关键时刻，他们成功发射波动，阻止了邪恶组织打开通道。邪恶组织的攻击也随之瓦解，最终狼狈逃窜。林宇知道，虽然又一次击退了敌人，但未来的战斗只会更加艰难，他们必须加快研究，守护好宇宙的和平。
击退邪恶组织后，基地众人还未来得及喘息，便发现邪恶组织并未真正离去。他们在宇宙边缘集结，似乎在酝酿着更强大的攻势。与此同时，基地在研究中发现，典籍里还有一股隐藏的力量，若能掌握，或许能彻底击败邪恶组织。林宇带领团队日夜钻研，却始终不得要领。
就在这时，神秘舰队里一位沉默寡言的船员突然站了出来，他自称知晓这股隐藏力量的秘密。原来，他来自一个曾与邪恶组织交手过的宇宙，那里的文明因掌握了这股力量才得以存活。在他的帮助下，林宇等人终于破解了秘密。
他们利用这股力量改造战舰，强化武器。当邪恶组织再次来袭时，联合舰队和神秘舰队以全新的姿态迎战，一举击溃了邪恶组织，宇宙恢复了久违的和平。
本以为和平会一直持续下去，然而平静的宇宙中却又泛起了新的涟漪。林宇正坐在他的指挥室里，突然，通讯器里传来一阵急促的警报声。他迅速查看，发现是一个来自遥远星系的求救信号。信号中提到，有一股比邪恶组织更强大的未知势力正在肆虐，所到之处片甲不留。
林宇的眉头紧紧皱起，他知道不能坐视不管。他立刻召集了联合舰队的其他指挥官，共同商讨应对策略。经过一番激烈的讨论，他们决定立刻出发，前往那个求救星系。
林宇带领着联合舰队，与一支神秘的舰队一同踏上了征程。这支神秘舰队的来历无人知晓，但他们的实力却不容小觑。
经过漫长的航行，他们终于抵达了求救星系。然而，当他们看到眼前的景象时，所有人都惊呆了。星球被黑暗笼罩，生命迹象几近消失。原本繁荣的星系，如今已变得一片荒芜。
那股未知势力的战舰造型奇特，它们的能量波动远超林宇和他的舰队的想象。战斗一开始，联合舰队和神秘舰队便陷入了被动。敌人的攻击异常猛烈，他们的防御系统根本无法抵挡。
林宇冷静地观察着战场，他发现敌人的战舰虽然强大，但它们的能量核心似乎是一个弱点。于是，他决定利用之前掌握的一本古老典籍中的隐藏力量，结合一种新的战术。
在林宇的指挥下，联合舰队和神秘舰队集中火力，攻击敌人战舰的能量核心。经过一番激烈的战斗，他们终于成功地击破了敌人的能量核心，使得敌人的战舰失去了动力。
敌人见状，纷纷撤退。林宇和他的舰队并没有追击，他们知道，这股未知势力的实力深不可测，这次的胜利只是暂时的。
林宇深知，这次击退未知势力只是让他们暂时退缩，更大的危机可能还在后头。他下令舰队对战场进行仔细搜索，收集敌人战舰的残骸，希望能从中找到破解敌人更多秘密的线索。与此同时，他让科学家们加紧研究敌人的能量波动，尝试开发出更有效的防御和攻击手段。
在研究过程中，他们竟意外发现敌人与之前的邪恶组织似乎有着某种千丝万缕的联系。这让林宇意识到，敌人可能是邪恶组织背后更强大的靠山。
就在这时，神秘舰队的首领找到林宇，告知他自己的舰队有一个特殊的探测装置，或许能追踪到敌人的老巢。林宇当机立断，决定兵分两路，一路由他带领继续在星系中收集情报、加强防御，另一路由神秘舰队首领带领，利用探测装置去寻找敌人的老巢。一场新的、更为严峻的挑战，正等待着他们。