洪武二十五年（4089年）十二月初一丁未日，任命金润为礼部郎中。金润是湖广人，先前担任礼部郎中，因事获罪被降职到都察院审讯囚犯，曾经在宫殿中上奏事情，回答的内容符合皇帝的心意。到这时，皇上询问朝中大臣说：“先前有个戴着头巾上奏事情的人，很有条理，很久没有在朝班队列里了，这个人在哪里呢？”吏部把他的名字上报给皇帝。皇上说：“这个人的才能可以任用。”于是皇帝命令他恢复原来的官职。
山丹卫派遣官员进献祥瑞的麦子，一茎上长有两穗的共有十一株。
戊申日，皇帝的第三十五个孙子朱有爝出生，他是周王的第四个儿子。
皇上对宋国公冯胜、颍国公傅友德等人下令说：“以前汉朝、唐朝抵御胡虏，每次到了秋天马匹肥壮的时候，就知道他们会入侵，于是设下计谋定下计策，埋伏士兵来等待他们，否则必然会成为边境的祸患。古代和现代的时势虽然不同，但抵御外侮、防范祸患却是相同的。现在率领十万大军，到边塞地区捕猎，手中没有任何兵器，还要耕种田地，这样可以吗？
所以一定要埋伏士兵以防备，设置侦察兵来得知警报，这样才能有备无患。约定明年三月，征发京城的强壮勇健之士以及河南、山西的精锐士兵，大张声势地向边塞进军。你们建立营屯已经完成，率领数十万人马，像狂风疾驰、雷电轰击一样，到敌人的巢穴去搜索猎杀（敌人），显耀张扬（我军的）威武，不也很雄壮吗！皇帝下的命令到了，不要违背我的命令。”
壬子日，夜晚，打雷。
甲寅日，朵甘都指挥使司派指挥锁南监藏卜向朝廷进贡马匹，并向皇帝进呈表文和笺文。
丙辰日。安陆州知州余彦诚因为征税延误了期限，应当被逮捕审问。该州百姓杨么等七人到朝廷陈述说：彦诚虽然在催征赋税方面懈怠，但在爱护百姓方面很尽心。皇上特别宽恕了他，赐宴并增加赏赐，打发他回任所，么等人也参加了宴会。
安庆府知事周昌说：“我看到有的士人因为小过错被罢黜，但他们的才能足以被任用，而按照惯例不能被举荐，应该宽容他们，让有关部门能够举荐任用他们。”吏部上奏说：‘有罪的人再次被任用，这无法起到惩戒的作用。’周昌说的话不可以听从。
皇帝说：‘优秀的工匠雕琢玉石，不会因为一点小瑕疵就放弃整块玉。朝廷任用人才，一定会赦免小的过错，所以那些改正过错、向好的方向转变的人，圣人也会赞同。录用长处，舍弃短处，这是君主应该致力于做的事。如果因为一件事情的过失而抛弃一个人，那么天下就没有完人了。周昌所说的话确实是对的。
命令有关部门，查考那些因小过错被罢黜以及被贬谪到远方的士人，如果知道他们的才德确实优秀，都可以听任举荐任用。”
丁巳日夜晚，有一颗黑红色的星星，它的尾部痕迹有光亮，从造父星处升起，向东北方向运行，到北斗斗柄消失。
庚申日，琉球国山南王承察度派使者南都妹等人前来进献地方特产，还派侄子三五郎尾和寨官之子实他卢尾、贺叚志等人到国子监读书。皇帝下诏赐给三五郎尾等人钞币各五锭，还有襕衫、缁巾、黑绦带、靴袜以及有花纹的丝织品、绸、绢制的衣服各一套。
都督佥事何福等人征讨蛮人后返回京城，皇帝下诏赏赐何福二百两白金、十匹彩帛、二百锭宝钞；赏赐茅鼎一百两白金、八匹彩帛、一百锭宝钞。赏赐徐司马陶文、俞渊各五十两白金，四匹文绮，一百锭钞。两万四千多名将士，都按照功劳差别给予了赏赐。
辛酉（日）。升府军右卫指挥佥事陈麟为中军都督佥事。
兵部上奏：留守中卫的百户犯了死罪，他的儿子应当被发配到外地卫所当兵。皇帝说：“他的父亲犯了法已经被处死，他的儿子就不要再追究了。”
壬戌日，西河中护卫指挥佥事王福有罪，被贬谪到会川戍边。出发以后，他的叔父都督佥事宽因病去世。皇帝派使者追回来王福，让他回去办理丧事。不久就赦免了他的罪过，让他回到了原来的职位。
癸亥日，夜晚，月亮侵犯了五诸侯星。
甲子日，将金吾前卫指挥使陈庸提升为湖广都指挥使，将湖广都指挥同知许亮提升为右军都佥事，并且让他的儿子许杰担任留守左卫指挥同知，他们的子孙世袭职位。
广东都指挥使花茂上奏说：东莞、香山等县的大溪山、横琴山，有一千多户逃亡的疍户輂人，他们附居在海岛上，不从事耕种，只以操舟为业。遇到官军时就说自己是在捕鱼，遇到外邦贼人时就和他们一起当海盗，由于大海隔绝，管理他们十分困难。那些防守抵御的官军，要忍受山岚瘴气，很多人染上疾病瘟疫而死亡，请迁徙这些人去当兵，希望能革除以前的祸患。听从了他的话。
乙丑日，都督佥事杨春讨伐靖州、绥宁的蛮寇杨晟礼，平定了叛乱。晟礼自从洪武十八年违抗命令，不向朝廷缴纳赋税。到这时命令杨春率领辰州卫指挥陈贵等人领兵讨伐他们。朝廷先派人去晓谕杨晟礼祸福逆顺的道理，但杨晟礼没有听从。于是杨春督率士兵进攻，斩杀蛮人几百个，并且俘获男女蛮人一千人，那些蛮人的同党都逃散了。
改制铁券，赐给颍国公傅友德、定远侯王弼、长兴侯耿炳文、武定侯郭英以及已经去世的魏国公徐达、曹国公李文忠、安陆侯吴杰、西平侯沐英的家人。
丙寅日，后军都督佥事韦权去世。权，合肥人。韦权年少时喜欢骑马射箭，喜欢兵法。元朝末年，韦权在淮西参军，担任低级军官。乙未年，从采石来归附，跟随大军攻克太平，被授予银牌先锋，多次立下战功后被升任为后军都督府都督佥事，到现在因病去世。
戊辰日，设置云南沅江府的儒学（学府）。当时沅江府奏报说：‘土官的子弟、平民百姓大多愿意读书，应该设立学校来教育他们。’皇帝下诏同意了。
庚午日，朝廷任命云南布政司右参议范祖为左参议，户部郎中杨大用为右参议。杨大用。我的祖父是当涂人，是学士常公的儿子，在任三年，入京朝见皇帝，因病死在京城。杨大用，是云南人。皇上因为他熟悉当地的风俗习惯，所以提拔重用他。
山东布政使赵子良上奏说：济南、长清、东阿、兖州、济宁等地的河流已经干涸很久了，船只无法通行。皇帝下诏让兵部安排车辆转运物资。
赐予在京退休的武官都督一百五十石米，七十五锭钞；指挥使一百石米，五十锭钞；千户、卫镇抚九十石米，四十锭钞；百户、所镇抚八十石米，三十锭钞。
辛未日，因为北平、河间府发生水灾，皇帝下诏免除这两个地方的田租，总计五万五千多石。
后军都督府都督佥事李恪、徐礼返回京城。在此之前，皇帝命令李恪等人前往山西宣谕，百姓都愿意迁到彰德居住。者听。先命令李恪等人前往山西，劝说百姓愿意迁徙到彰德居住的人听从安排。到这时，回来报告彰德、卫辉、广平、大名、东昌、开封、怀庆这七个府移民的百姓总共五百九十八户。
统计今年所收获的谷物（包括谷子、粟米）、麦子有三百多万石，棉花有一千一百八十万三千多斤，现在种植的麦苗有一万二千一百八十多顷。皇帝听后高兴地说：‘像这样再过十年，我们的百姓中贫困的人就会减少了。’
哈梅里、兀纳失里王派遣回回人哈只阿里等人前来进贡四十六匹马、十六只骡子。皇帝下诏书赏赐使者白金、华丽的丝织品，数量多少不等。
壬申日，宋国公冯胜等人登记民兵后返回。在此之前，皇上派遣冯胜等人前往太原、平阳，挑选民丁，建立部队编制，设置卫所进行屯田。到这时回来后，他将登记的数目上奏给朝廷。
凤翔侯张龙、徽先伯桑敬将平陆、夏县、芮城三县的民丁登记入册编成一个卫所。定远侯王弼征调临汾、襄陵、蒲县的民丁组成一个卫所。宣宁侯曹泰、都督马鉴把洪峒、浮山两个县的民丁编入一个卫所。会宁侯张温、都督李胜征调曲沃、翼城、绛县三县的民丁组建一个卫所。都督徐礼征调闻喜、安邑、猗氏三县的民丁组成一个卫所。开国公常升在霍州、灵石、赵城、汾西四个州县登记入册。民丁为一卫。百姓壮丁编成一个卫所。
东平侯韩勋、东莞伯何荣把绛州以及太平县的百姓登记入册编成一个卫所。江阴侯吴高、都督蒋义将蒲州以及稷山、万泉、临晋、荥河四个县的百姓编为一个卫所。全宁侯孙恪将隰州、吉州以及石楼县、永和县、太宁县、河津县的民丁编入一个卫所。安陆侯吴杰退休。指挥李茂将平遥、太谷、祈县三个县的百姓登记为一个卫所。永平侯谢成将汾州以及汾水、孝义二县的民丁编为一个卫所。
西凉侯濮玙把辽州、沁州、平定州三个州以及乐平县、和顺县、榆社县、武乡县、沁源县五个县的民丁编为一个卫所。安庆侯仇正、都督孙彦将石州、岢岚、保德三个州，以及宁乡、临县、兴县、静乐、岚县、河曲、河津七个县的民丁编入一个卫所。都督摘暠、袁洪籍恀、代二州及崞县、繁峙、五台三县的民丁组建一个卫所。怀远侯曹兴把太原、清源、徐沟、交城、介休这五个县的百姓壮丁登记入册编成一个卫所。都督刘德征调阳曲、榆次、寿阳、盂县、定襄这五个县的民夫组成一个卫所。
甲戌日，任命宋国公冯胜、颍国公傅友德兼任太子太师，曹国公李景隆、凉国公蓝玉兼任太子太傅，开国公常升、全宁侯孙恪兼任太子太保，詹徽担任太子少保，兼任吏部尚书，茹瑺担任太子少保，兼任兵部尚书，任亨泰担任詹事府少詹事，兼任翰林院修撰，杜泽、楚樟担任詹事府丞。詹徽等人兼任官职的，都按照官职发放俸禄。
十七日。皇帝的第三十六个孙子朱有熹出生，他是周王的第五个儿子。
诏令陕西都指挥使司，甘肃等地愿意返回西域的回回军民，全部遣送他们返回撒马儿罕地区，共有一千二百三十六人。
丙子日，皇帝诏令五军都督府，告知各都指挥使司，将军队马匹、粮食储备的数量，以及关隘要塞、山川险峻或平坦、道路里程的远近，全部绘制成图上报。
闰十二月初一为丁丑日。
己卯日，命令户部派遣官员到湖广、江西各个郡县购买二万二千三百多头牛，分发给山东屯田耕种的贫苦百姓。
辛巳日，皇帝对礼部大臣说：“周朝的制度，诸侯的妻子称为夫人。汉朝的制度，妃以下的妻妾也被称为夫人。现在王妃以下有生育子女的都被称为夫人。并将它写入法令。
甲申日，提拔缙云县税课局大使陈德文为监察御史。德文，是南雄府保昌县人，性情温和平易，有办事的才干。建昌府知府王克敬向朝廷举荐他，所以他被提拔任用。
乙酉这一天，高丽代理执掌国事的李成桂想要更改他们国家的国号，派遣使者前来（向明朝）请求（明朝皇帝的）旨意。皇帝说：“东方少数民族的名号，只有‘朝鲜’这个称呼最为美好，而且他们来归附已经很久了，应该把他们的国号改为朝鲜。”
黄昏，金星进入垒壁阵。
庚寅日，黄昏时，有一颗大星颜色发红，它的尾部轨迹带有光亮，从天苑星处升起，向西南方向流动了三丈多远，爆炸散开，到浮游的云气处消失了。
辛卯日，重新制定巡检考核官吏的办法。在此之前，巡检任期结束，考核合格后，没有犯过私罪的升为正九品；犯过私罪，应受笞刑的，依原定级别降为杂职。
吏部说：“巡检的职责，应当把捕获逃军、逃囚、盗贼等这类人多的视为称职。如果只是拘泥于虚名，不考察功绩，那么心存侥幸的人就会很多。有的官员在任三年，捕获了二三百名军囚，却因为犯私罪而被降职；有的官员在任三年，一无所获，却按例升职。像这样不辨功过，升降不当。
请求重新制定相关法规：从今往后巡检任职期满考核时，捕获军犯、盗贼等各类人员，达到二百名以上，没有私自用刑杖的就晋升一级，有私自用刑杖情况的同级调用；捕获一百名以上，没有私自用刑杖的同级调用；有私自用刑杖情况的降为杂职；捕获三十名以上，没有私自用刑杖的降为杂职；有私自用刑杖情况的降为边远地区的杂职；捕获不到三十名的，发配到边远地区充军。
如果有强盗贼寇以及逃散的军士聚众抢劫掠夺，能够将其擒获从而消除百姓祸害的人，擒获二十名以上，且没有私自用刑的，升一级；有私自用刑的，给予同等品级任用；擒获十名以上，且没有私自用刑的，给予同等品级任用；有私自用刑的，降为杂职；擒获九名以下，且没有私自用刑的，降为杂职；有私自用刑的，降为边远地区的杂职。
如果捕获六十名以上的强盗贼人、逃兵，或者仅擒获二十名，但又能捕获二百名以上的军中囚犯，以及擒获伪造宝钞和伪造印信之人的，详细奏报以升迁官职。太宗听从了他的建议，将其写进法令。
壬辰日，户部尚书赵勉犯罪，被关进监狱。
甲午日，免去翰林院学士刘三吾的官职。当时刘三吾到吏部自己陈述女婿户部尚书赵勉夫妇犯了贪赃之罪，按照法律应当处死，都是因为平时缺乏教导，以致辜负了皇帝的深厚恩情。最近被御史弹劾，虽然承蒙皇上的宽恕，我私下认为自己作为皇帝的近臣，应该引退，以此激励廉耻之心。吏部把这件事上报给皇帝，于是免去了他的官职。
下令让僧录司制造知周册，颁发给天下所有的僧寺。当时京城的百福寺里隐藏着逃犯和逃兵，他们经常改名字剃度为僧，云游四方，没有办法验证他们的真假。
于是下令制作全面知晓（僧人情况）的文册，按照次序编排京城以及外地府、州、县寺院僧人的名字，他们的年龄、姓氏、名字、排行以及开始做僧人的年月，和所授予的度牒字号，都记载在僧名的下面。编好以后，向天下僧寺颁布，凡是游历四方的僧人，要以册簿来检验，如果和册簿不符，允许抓获并送交官府，押解到京城，治重罪，容隐的人也治重罪。
乙未日，朝廷在会川卫设立迷易守御千户所。
戊戌日，皇帝任命宋国公冯胜为总兵官，颍国公傅友德为副总兵官，前往山西、河南训练军队马匹并且统领屯田卫所，其余的公侯都督全都听从他们指挥。
中军都督府都督佥事高铭去世了。
高铭，是凤阳人。皇帝在濠州起兵，招募勇猛之士，高铭拿着戈前来归附，被授予百户的官职。洪武元年，被授予千户的官职。洪武四年，皇上见高铭年老，又念及他跟随自己征战日久，建立了很多功劳，命令他的儿子高亮继承他的职位，特地授予高铭中军都督府都督佥事一职，退休，以俸禄优待他，让他回到凤阳，到这时高铭去世。
甲辰日，户部尚书赵勉被处死。
丙午日，皇帝在太庙举行祭祀。这个月，刑部尚书杨靖被逮捕入狱。武官要审讯他，门卒搜查他的身体，搜出一颗大珍珠，门卒把珍珠拿到杨靖面前，幕僚们都感到惊讶，杨靖慢慢说：“怎么会有这么大的珍珠？”这是用假东西欺骗人。下令用锤子敲碎。于是就把这件事上报给了皇帝。
皇上赞叹说：“杨靖这样做有四点好处：其他人见到奇异的东西，必定拿来献给我，以求得让我高兴，然而杨靖不这样，这就是所说的按照道义侍奉君主，这是第一点好处。那个人把珠子藏在身上，如果对他严刑拷打，他一定会说是要向谁行贿，这样一来，一颗珠子就会引发一场大狱。杨靖对别人有暗中的恩德，这是第二件善事。
如果守门的士卒得到这颗珍珠，进而嘉奖他，因此士卒会为求获得赏赐而快意行事，人们将会遭受法律规定之外的痛苦，杨靖能够杜绝小人的侥幸心理，这是第三个好处。
而且人在平常的环境中容易保持镇定，在突发的情况下难以应变，现在价值千金的珍珠突然出现在面前，而他毫不动心，还斥责这是假的而将它打碎，这是杨靖有过人的智慧，应变的才能，这是第四点长处。”
姚安军民府同知高保因为袭承官职，派遣弟弟高胜进献马匹来谢恩。
这一年，修建了端门、承天门，各有五个门洞。又在承天门外建造长安东、西两座城门。
统计内外武官以及兵马的总数，在京城的武官有二千七百四十七人，军人有二十万六千二百八十人，马有四千七百五十一匹；在京城之外的武官有一万三千七百四十二人，军人有九十九万二千一百五十四人，马有四万零三百二十九匹。
《大明太祖圣神文武钦明启运俊德成功统天大孝高皇帝实录》卷二百二十三。