本源探索舰穿过本源裂隙，进入本源宇宙后，立刻朝着暗黑星域的方向疾驰。舰桥的全息投影上，显示着本源联盟提供的暗黑星域地图——这是一片位于本源宇宙边缘的星域，星域内布满了暗黑能量形成的“暗黑星云”，星云能干扰雷达探测，还能缓慢腐蚀任何进入的飞船；暗黑文明的基地位于星域中心的“暗黑星球”，星球周围部署了五十座“暗黑本源炮”，炮口对准星域入口，形成一道严密的防御线。
“根据本源联盟的情报，暗黑文明的残余势力约有两百艘战舰，五万暗黑战士，为首的是暗黑文明的‘暗黑大帝’，实力达到了‘本源境后期’，”蔚蓝长老的声音通过本源通讯器传来，“本源联盟的联军已在暗黑星域外围集结，共有三百艘战舰，十万战士，分为三个战斗编队，你们的探索舰编入第一编队，负责突破暗黑星云的干扰，摧毁外围的暗黑本源炮。”
林越点头：“明白！我们的本源净化炮已升级，能净化暗黑星云的干扰；创世能量护盾也能抵御暗黑能量的腐蚀，突破外围防御没问题。”
三天后，本源探索舰抵达暗黑星域外围，与本源联盟的联军汇合——联军的战舰种类繁多，蔚蓝文明的蓝色战舰、晶灵文明的紫色战舰、炎火文明的红色战舰、瀚海文明的蓝色战舰、厚土文明的黄色战舰，整齐地排列在星域外围，舰身上的能量护盾泛着各自文明的光芒。
蔚蓝长老站在联军旗舰的舰桥，通过全息投影对所有联军成员说道：“暗黑文明的暗黑本源炮能释放出‘暗黑本源射线’，一旦被击中，战舰会被瞬间腐蚀，战士会被暗黑能量控制。我们的战术是：第一编队突破暗黑星云，摧毁暗黑本源炮；第二编队负责清理暗黑战舰；第三编队保护联军旗舰，同时支援第一、二编队。战役开始！”
“第一编队，出发！”林越下令，本源探索舰与二十艘蔚蓝文明、晶灵文明的战舰组成第一编队，朝着暗黑星云疾驰。星云内的暗黑能量如同黑色的雾气，不断腐蚀战舰的护盾，雷达屏幕上满是干扰信号，根本无法锁定目标。
“启动本源净化炮，净化暗黑星云！”钢心长老操控探索舰，十座本源净化炮同时发射，淡蓝色的净化光束射向暗黑星云，星云内的暗黑能量被快速净化，形成一道清晰的通道；特蕾莎则释放创世混沌能量，在编队周围形成一道能量屏障，进一步抵御暗黑能量的腐蚀；玲珑释放创世生命能量，修复战舰护盾的损伤。
编队沿着净化通道前进，很快就抵达暗黑本源炮的防御线——五十座暗黑本源炮排列在暗黑星球的外围，炮身漆黑，泛着浓郁的暗黑能量，炮口对准了第一编队。“暗黑本源炮，开火！”暗黑战士的吼声传来，五十道黑色的暗黑本源射线射向编队。
“创世能量护盾，全力防御！”林越下令，探索舰的护盾瞬间暴涨，淡金色的光芒挡住了暗黑本源射线，射线击中护盾，护盾剧烈闪烁，却始终未破；其他战舰也纷纷激活护盾，抵挡射线攻击。
“本源净化炮，锁定暗黑本源炮！”钢心长老调整炮口方向，净化光束射向最近的一座暗黑本源炮，炮身瞬间被净化，化为一缕黑烟；晶灵文明的战舰也发射晶体光束，击中另一座暗黑本源炮，炮身轰然爆炸。
暗黑战士见状，纷纷操控暗黑本源炮调整目标，密集的暗黑本源射线射向编队。“李白、斯嘉丽，你们乘坐登陆艇，摧毁暗黑本源炮的控制中心！”林越下令，李白和斯嘉丽乘坐小型登陆艇，冲出探索舰，朝着暗黑星球的控制中心疾驰。
登陆艇穿过暗黑能量的干扰，抵达控制中心——控制中心是一座由暗黑金属打造的堡垒，周围有大量暗黑战士守卫，手中握着暗黑长矛，体表泛着暗黑能量。“创世星灵斩！”李白纵身跃起，金青剑气劈向暗黑战士，成片的战士被净化；斯嘉丽则激活创世暗影纹，潜行至堡垒内部，创世暗影匕首刺向控制中心的核心，核心瞬间被摧毁，所有暗黑本源炮同时停止攻击。
“第一编队，突破成功！暗黑本源炮已被摧毁！”林越的声音传遍联军通讯频道，第二编队的战舰立刻发起攻击，红色的炎火光束、蓝色的瀚海光束、黄色的厚土光束，射向暗黑文明的战舰，成片的战舰被摧毁，暗黑能量在本源能量的净化下化为黑烟。
暗黑星球的内部，暗黑大帝得知外围防御被突破，愤怒地砸碎了指挥台：“一群废物！连个外围防御都守不住！所有人，跟我出击，让这些渺小的文明尝尝暗黑本源的厉害！”
暗黑大帝带领五万暗黑战士，乘坐一百艘暗黑战舰，冲出暗黑星球，朝着联军发起反击。他身着暗黑本源铠甲，手中握着一柄暗黑本源剑，周身环绕着黑色的暗黑本源能量，实力远超之前的暗黑领主。
“本源境后期的实力，”林越握紧焚天刃，五系炎火创世灵纹爆发金光，“李白、斯嘉丽，你们协助第二编队清理暗黑战舰；特蕾莎、玲珑，你们用创世能量干扰暗黑大帝的暗黑本源能量；我来正面牵制他！”
林越纵身跃出探索舰，焚天刃凝聚所有能量，“五系炎火本源创世斩！”一道五彩火焰剑气劈向暗黑大帝，剑气中蕴含的本源能量让暗黑大帝脸色骤变，他急忙用暗黑本源剑抵挡，剑气击中剑刃，剑刃瞬间被劈出一道裂痕，暗黑大帝被震得连连后退。
“竟然能挡住我的暗黑本源剑！”暗黑大帝眼中闪过一丝惊讶，随即露出更浓郁的杀意，“暗黑本源领域！”黑色的领域在暗黑大帝周围展开，领域内的暗黑本源能量如同潮水般涌向林越，试图将他吞噬。
暗黑本源领域展开的瞬间，黑色能量如同黏稠的墨汁，将林越周身的空间彻底封锁。领域内的暗黑能量带着吞噬一切的特性，不断侵蚀林越体表的创世光甲，光甲上的金色灵纹虽在奋力抵抗，却也开始出现细微的裂痕，淡金色的创世能量与黑色的暗黑能量碰撞，发出“滋滋”的消融声。
“在我的暗黑本源领域里，你的创世能量撑不了多久！”暗黑大帝冷笑一声，手中的暗黑本源剑凝聚起浓郁的黑色能量，剑身上浮现出扭曲的暗黑符文，“暗黑本源斩！”一道巨大的黑色剑气劈向林越，剑气所过之处，空间都被撕裂出细小的裂缝，带着毁灭一切的威势。
林越握紧焚天刃，跨维守护印在掌心发烫，五系创世灵纹同时爆发——金色的金属灵纹增强刀刃硬度，绿色的生命灵纹修复光甲裂痕，蓝色的水灵纹凝聚防御屏障，红色的火灵纹提升攻击温度，褐色的土灵纹稳固脚下空间。“五系创世·本源防御！”五彩能量在身前凝聚成一道厚重的屏障，黑色剑气劈在屏障上，剧烈的爆炸瞬间掀起能量风暴，林越被冲击波震得连连后退，嘴角渗出鲜血，焚天刃的握柄都被掌心的汗水浸湿。
“林盟主！我们来帮你！”蔚蓝长老的声音从联军通讯频道传来，只见本源联盟的五艘旗舰同时调转炮口，淡蓝色的本源净化炮、紫色的晶体破碎炮、红色的炎火毁灭炮、蓝色的瀚海冲击炮、黄色的厚土禁锢炮，五道不同颜色的能量光束同时射向暗黑本源领域，光束中蕴含的本源能量与创世能量同源，瞬间在领域上撕开五道裂缝。
特蕾莎和玲珑也抓住机会，从探索舰上纵身跃出——特蕾莎的黑色宝石泛着金紫交织的光芒，“创世混沌·能量干扰！”金紫能量如同蛛网般缠绕住暗黑本源领域的裂缝，不断扩大缺口；玲珑则释放“创世生命·生机缠绕”，绿色的生命能量顺着裂缝渗入领域，缠绕在林越周身，修复他的伤势，同时削弱暗黑能量的侵蚀。
“该死的本源联盟！”暗黑大帝怒喝一声，不得不分出部分能量修补领域裂缝，领域对林越的压制瞬间减弱。林越抓住这转瞬即逝的机会，焚天刃凝聚起全身的创世能量，五系灵纹在刃身流转成一道五彩光环，“五系创世·终极斩！”五彩剑气带着撕裂空间的威势，劈向暗黑大帝的暗黑本源剑。
“铛！”金铁交鸣的巨响震彻整个暗黑星域，五彩剑气与黑色剑气相撞，能量冲击波朝着四周扩散，附近的几艘暗黑战舰被波及，舰身瞬间被净化成粉末。暗黑大帝手中的暗黑本源剑出现密密麻麻的裂痕，他被剑气的冲击力震得倒飞出去，重重撞在一艘暗黑旗舰的舰桥上，旗舰的护盾瞬间破碎，舰身燃起黑色的火焰。
“暗黑战士！跟他们拼了！”暗黑大帝抹去嘴角的黑血，嘶吼着下令。剩余的暗黑战舰如同疯魔般冲向联军，暗黑战士们甚至引爆自身的暗黑能量，试图与联军战舰同归于尽。但本源联盟的联军早已做好准备——蔚蓝文明的战舰释放出淡蓝色的本源护盾，挡住自爆冲击；晶灵文明的战舰发射晶体网，困住失控的暗黑战舰；炎火文明的战舰释放炎火屏障，净化自爆产生的暗黑能量；瀚海文明的战舰操控水流，扑灭暗黑火焰；厚土文明的战舰则用厚土能量加固防御，确保联军阵型不被冲散。
李白和斯嘉丽此时已清理完外围的暗黑战舰，正朝着暗黑大帝的旗舰疾驰。李白的青莲剑凝聚金青交织的创世剑气，“创世星灵·万剑归宗！”无数剑气如同暴雨般射向旗舰的舰桥，暗黑大帝不得不再次起身抵挡，却被剑气划伤手臂，黑色的血液滴落在舰桥甲板上，瞬间腐蚀出一个个小洞。
斯嘉丽则激活创世暗影纹，身影如同鬼魅般潜入旗舰内部，创世暗影匕首泛着淡淡的金光，精准刺向旗舰的能量核心——核心被刺穿的瞬间，旗舰的所有系统陷入瘫痪，暗黑大帝失去了最后的屏障，暴露在联军的火力范围内。
“暗黑大帝！放弃抵抗吧！”林越悬浮在旗舰前方，焚天刃指着暗黑大帝，“你的势力已被摧毁，暗黑星域即将被净化，再抵抗下去，只会被彻底湮灭！”
暗黑大帝看着周围密密麻麻的联军战舰，又看了看远处正在被净化的暗黑星云，眼中闪过一丝绝望，却又很快被疯狂取代。他突然大笑起来，双手抓住自己的暗黑本源核心，黑色能量在他周身疯狂汇聚：“想让我投降？不可能！就算我死，也要拉你们一起陪葬！暗黑本源·自爆！”
“不好！他要自爆本源核心！”蔚蓝长老脸色骤变，“所有战舰，全力释放本源护盾！林盟主，快阻止他！”
林越纵身跃起，跨维守护印完全激活，金色的创世能量如同太阳般爆发，“跨维创世·封印！”金色光罩将暗黑大帝牢牢困住，试图阻止他的自爆。但暗黑大帝已彻底疯魔，暗黑本源核心的能量爆发速度越来越快，黑色能量不断冲击金色光罩，光罩上的创世灵纹开始快速消退。
“特蕾莎！用创世混沌能量压制！玲珑！生命能量加固封印！”林越大声喊道。特蕾莎立刻将所有创世混沌能量注入光罩，金紫能量交织，增强光罩韧性；玲珑则释放出最浓郁的创世生命能量，绿色光带缠绕在光罩外侧，与金色光罩形成双重防护。
就在暗黑本源核心即将彻底爆发的瞬间，本源联盟的五艘旗舰同时释放出本源核心能量，五道能量光束汇聚成一道五彩的本源光柱，射向金色光罩——光柱中的本源能量与创世能量完美融合，光罩瞬间暴涨，将暗黑本源核心的能量彻底压制。暗黑大帝发出一声凄厉的哀嚎，身体在双重能量的压制下快速消融，最终化为一缕黑色的烟雾，被本源光柱彻底净化。
暗黑大帝被消灭，剩余的暗黑势力失去了核心，纷纷放弃抵抗，有的战舰选择逃离暗黑星域，却被联军的战舰拦截净化；有的暗黑战士选择投降，被联军关押起来，等待后续的本源净化。
三个时辰后，暗黑星域的清理工作基本完成——暗黑星云被本源净化炮和创世能量共同净化，露出了原本清澈的星域；暗黑星球上的暗黑设施被彻底摧毁，星球表面被本源能量覆盖，开始缓慢恢复生机；五十座暗黑本源炮被拆解，核心部件被带回联军旗舰，用于研究和改进本源武器。
林越站在本源探索舰的舰桥上，看着全息投影中逐渐恢复正常的暗黑星域，心中松了口气。特蕾莎和玲珑走到他身边，递过一杯用创世能量滋养的星露茶：“终于结束了，暗黑文明的威胁彻底解除了。”
林越接过茶杯，浅尝一口，温暖的能量顺着喉咙流入体内，之前战斗的疲惫感瞬间消散。“这只是本源宇宙的第一场战斗，”他看着投影中本源联盟的战舰正在有序撤离，“未来还会有更多的威胁，我们需要尽快整合暗黑文明的科技，提升联军的实力，为接下来的挑战做好准备。”
蔚蓝长老的声音此时通过通讯器传来，带着欣慰的笑容：“林盟主，本源联盟决定在蔚蓝星域召开庆功大会，同时商议后续的合作计划，你们的本源探索舰也一起过来吧，我们还有重要的事情要和你商量。”
林越点头：“好，我们随后就到。”
本源探索舰缓缓调转方向，朝着蔚蓝星域的方向疾驰。舰窗外，暗黑星域的黑色渐渐褪去，取而代之的是璀璨的星辰，仿佛在预示着本源宇宙的和平即将到来。但林越心中清楚，这只是开始，从暗黑大帝最后的疯狂中，他隐约感觉到，本源宇宙中还隐藏着更大的威胁，而这威胁，很可能与百万年前的暗蚀始祖有关。