青牛村东头的药田在晨雾中泛着奇异的光泽，刘镇南蹲在龙胆草丛中，指尖轻触微微颤动的草叶。这些本该在秋季成熟的灵植，此刻竟在初春时节泛起不自然的暗金纹路。林素衣提着药篮匆匆赶来，篮中清晨采集的露珠凝结成冰晶状，在阳光下折射出七彩光芒。
镇南哥，紫云草开花了！少女声音带着惊惶。她指向药田东南角，那里本应秋季开花的紫云草，此刻竟绽放出妖异的七色花朵，花瓣边缘还带着细密的锯齿。
刘镇南掐碎一枚清心草叶，草屑飘落时突然自燃，在空中划出警示符纹。这是药神谷典籍中记载的草木惊变之兆。他快步走向古井，发现井水表面凝结着一层薄冰，冰下隐约有暗流涌动。
午时三刻，村外传来急促马蹄声。七名身披藤甲的修士闯入药田，为首者手持玉尺轻点，尺风过处草木尽数枯萎。这片灵田，我们万草门征收了。藤甲修士冷笑着挥尺，地面裂开数道缝隙。
刘镇南挺身护住林素衣，药锄深深插入泥土。就在双方对峙时，异变突生——枯萎的草木根部突然生出新芽，以肉眼可见的速度疯狂生长，转眼间就将万草门众人团团围住。这些新生的藤蔓带着尖刺，刺尖渗出幽蓝汁液。
夜幕降临时，更惊人的变化出现了。所有发生异变的灵植在月光下开始散发柔和光晕，这些光晕在空中交织成古老阵图。老药师认出这是失传已久的草木通灵阵，据说能令凡草开启灵智。
子时月光最盛时，阵图中心突然裂开缝隙，无数妖植种子如暴雨般倾泻而下。这些种子遇土即生，长出的藤蔓如活物般攻击村民。危急关头，刘镇南将平日收集的各类药种撒向裂缝，不同属性的草药相互克制，竟在裂缝处形成微妙平衡。
黎明时分，刘镇南发现异变灵植散发的光晕能克制妖植。他冒险引动药田积蓄的草木精华，以身为媒构筑灵阵。就在阵法将成时，万草门去而复返，竟要趁火打劫。三方混战中，一株最普通的龙胆草突然绽放出耀眼金芒。
这株被刘镇南精心培育三年的灵草，竟在关键时刻通灵化形，化作金甲卫士护住全村。金甲卫士手持药锄虚影，每挥一次就有妖植枯萎。万草门修士见状大惊，纷纷祭出本命法宝。
战斗持续了整整三日。期间刘镇南发现异变灵植需要特定频率的灵气滋养，他根据药神谷传承，调配出稳定灵植的药剂。林素衣则带领村民布下防护结界，防止妖植种子扩散。
到第四日黄昏，异变灵植渐渐恢复常态，但其中几株明显开启了灵智。那株化形的龙胆草更是能随刘镇南心意移动，甚至能帮他照料其他灵植。万草门修士见讨不到便宜，终于悻悻离去。
霞光初现时，刘镇南轻抚那株救主的龙胆草，感受到其中微弱却坚韧的灵性波动。他发现这些异变灵植不仅没有危害，反而让药田灵气更加充沛。老药师采集新生的灵植入药，发现药效堪比百年灵草。
然而就在村民欢庆时，村东头的古井突然涌出漆黑泉水。井水所到之处，草木再次发生异变，这次长出的却是带着毒刺的妖植。更可怕的是，这些妖植竟能吞噬其他灵植的灵气。
刘镇南连夜查阅药神谷典籍，发现这是噬灵妖植的征兆。必须找到妖植的母体才能彻底解决危机。他带着那株通灵龙胆草深入后山，在悬崖边发现一株巨大的妖植母体。
这株妖植母体竟是由无数毒草纠缠而成，中心开着朵血红的花朵。花朵中不断喷出黑色种子，随风飘向村庄。刘镇南福至心灵，将通灵龙胆草种在妖植旁，龙胆草立刻散发出净化金光。
在金光照射下，妖植母体逐渐枯萎，最终化为一滩清水。但刘镇南注意到，清水渗入地底后，土壤中浮现出诡异的符文——这分明是有人故意种下的妖植！
返回村庄后，刘镇南加强了对药田的防护。他在四角种下通灵龙胆草的分株，这些分株能自动识别并清除妖植。林素衣则带人日夜巡逻，防止有人再次破坏。
七日后的月圆之夜，药田突然再次异动。所有灵植同时开花，花香凝聚成雾，在月光下显现出一幅古老地图。地图指向村外一处荒废的药园，那里据说曾是药神谷的遗址。
刘镇南带领村民前往探查，在废墟中发现了一本残破的药典。药典记载着一种名为万物生的古老秘术，能令草木通灵，但若被心术不正之人使用，也会让灵植妖化。
就在众人研究药典时，暗处突然射来数支毒箭。一个黑影快速掠过，抢走了半部药典。刘镇南急忙追赶，却发现对方对地形极为熟悉，转眼就消失在山林中。
返回村庄后，刘镇南决定更加用心培育这些通灵灵植。他发现通过不同灵植的组合，能产生各种神奇效果。一株紫云草与龙胆草相伴，竟能结出治愈内伤的灵果；夜交藤与晨露花共生，则可产生安神静气的香气。
然而危机并未解除。每月月圆之夜，总会有新的妖植出现。刘镇南渐渐明白，这是有人在暗中试探，想要窃取通灵灵植的秘密。他悄悄布下陷阱，终于在一个雨夜抓住了幕后黑手。
令人震惊的是，这人竟是村中失踪多年的老药师！原来他一直在暗中研究灵植异变，想要借此掌控整个青牛村的灵脉。老药师狂笑着说出一个更惊人的秘密：刘镇南培育的那株龙胆草，正是药神谷失传已久的灵犀草。
这种灵草能感应人心，与培育者心意相通。若是善用可造福苍生，若是恶用则后患无穷。老药师就是想要得到这株灵草，才不断制造妖植危机。
刘镇南最终将老药师交给村中长老会处置，自己则继续研究灵植之道。他发现在灵犀草的帮助下，自己能更清晰地感知草木需求，甚至能与它们进行简单交流。
渐渐地，青牛村的药田成了远近闻名的灵植圣地。而刘镇南不知道的是，这场灵植异变，正是他踏上真正药修之路的开始......