在江南水乡有个清河镇，此地河网密布，百姓们靠水吃水，世代以捕鱼、航运为生，日子过得倒也安稳。然而，平静的生活却被一场突如其来的灾难打破了。
不知从何时起，清河镇外的那条大河开始兴风作浪。原本平静的河面时常波涛汹涌，河水泛滥成灾，冲毁了许多农田和房屋。更可怕的是，还时常有水妖作祟，将过往的船只掀翻，把渔民拖入水中，百姓们人心惶惶，不敢再轻易靠近河边。
这一日，疯疯癫癫的济公和尚云游到了清河镇。他穿着一件补丁摞补丁的僧袍，腰间系着一根破草绳，脚蹬一双露出脚趾的旧草鞋，手里摇着一把破蒲扇，嘴里哼着不成调的小曲儿，大摇大摆地走进了镇子。
镇上的百姓们看到济公这副模样，都投来好奇又带着几分不屑的目光。但济公却毫不在意，他看到百姓们个个愁眉苦脸，便拉住一位老渔夫问道：“老丈，这镇子是怎么啦，怎么大家都不开心？”老渔夫长叹一声，把水妖作恶、河水泛滥的事一五一十地告诉了济公。
济公听后，眼睛一亮，笑着说：“老丈莫忧，我济公既来了，定要为你们除了这水妖，退了这洪水。”老渔夫以为济公在吹牛，苦笑着说：“大师，您就别拿我们寻开心了，那水妖凶猛异常，洪水又来势汹汹，您一个人能有什么办法？”济公拍了拍胸脯说：“放心放心，我自有妙计。”
济公先来到河边查看情况。只见河水浑浊不堪，波涛滚滚，隐隐有一股阴森的气息从河底传来。济公站在河边，口中念念有词，突然，他纵身一跃，跳进了河里。百姓们在岸上看到这一幕，都惊得目瞪口呆，纷纷议论起来：“这疯和尚是不是疯了，跳进河里不是找死吗？”
济公跳进河里后，施展法术，让自己能够在水中自由呼吸和行动。他顺着水流往河底游去，不一会儿，就看到了一个巨大的洞穴。那洞穴周围散发着幽绿色的光芒，还不时传来阵阵低沉的咆哮声，显然就是水妖的巢穴。
济公小心翼翼地游进洞穴，只见里面阴森恐怖，水草乱舞。在洞穴的深处，一只巨大的水妖正趴在那里睡觉。这水妖身形如牛，浑身长满了黑色的鳞片，头上长着两只尖锐的角，嘴里还露出锋利的牙齿，模样十分狰狞。
济公没有惊动水妖，而是悄悄地绕到它的身后，从怀里掏出一个破酒葫芦。他打开葫芦盖，往水妖身上倒了一些酒。那酒一碰到水妖的身体，就发出一阵“滋滋”的声响，冒出一股青烟。水妖被这刺痛惊醒，它愤怒地咆哮起来，转过身看到济公，立刻张开血盆大口，向济公扑来。
济公不慌不忙，他挥动手中的破蒲扇，扇出一股强大的水流，将水妖的攻击挡了回去。然后，他一边和水妖周旋，一边观察着洞穴的环境。他发现洞穴的顶部有一些松动的石头，心中顿时有了主意。
济公故意卖了个破绽，引得水妖向他猛扑过来。就在水妖快要扑到他身上时，济公侧身一闪，水妖收不住力，一头撞在了洞穴的顶部。那些松动的石头被撞得纷纷掉落下来，砸在水妖的身上。水妖被砸得晕头转向，但它很快就清醒过来，再次向济公发起攻击。
济公知道这样下去不是办法，他决定用激将法把水妖引出洞穴。他对着水妖大声喊道：“你这胆小如鼠的水妖，有本事就跟我到河面上大战一场，躲在这洞穴里算什么英雄好汉！”水妖被济公的话激怒了，它咆哮着冲出了洞穴，向河面游去。
济公也跟着水妖游出了洞穴。此时，河岸上已经聚集了许多百姓，他们看到济公和水妖从河里冒了出来，都紧张得大气都不敢出。水妖浮出水面后，对着济公张牙舞爪，准备再次发动攻击。
济公却站在原地，不慌不忙地从袖中掏出一串佛珠。他口中念念有词，佛珠瞬间发出耀眼的金光，变成了一个巨大的金色圆环，将水妖困在了中间。水妖拼命挣扎，想要冲破圆环的束缚，但那圆环却越收越紧。
就在水妖挣扎得筋疲力尽的时候，济公大声喝道：“你这水妖，本在河中修炼，却不知珍惜，出来作恶害人，今日我济公就要替天行道，将你收服！”说着，他双手一合，那金色圆环便带着水妖缓缓升到了空中。
济公又施展法术，将河水引回了河道，让泛滥的洪水渐渐退去。百姓们看到这一幕，都欢呼雀跃起来，他们纷纷跪在地上，向济公磕头谢恩：“大师，您真是我们的救命恩人啊！要不是您，我们这清河镇就要被洪水淹没了，我们都要被水妖害死了！”
济公笑着将百姓们扶起，说：“大家不必如此，这是我济公应该做的。以后大家要爱护这河水，莫要再做破坏环境之事，以免再惹来妖邪。”
从那以后，清河镇又恢复了往日的平静与繁荣。百姓们为了纪念济公的恩德，在河边修建了一座济公庙，香火十分旺盛。而济公和尚，则继续着他的云游生活，四处行侠仗义，他的故事也在民间代代相传。