在红叶村神社击退黑衣组织后，柯南等人深知形势紧迫。警方对神社周边及地下室进行了严密封锁，但众人清楚，黑衣组织绝不会轻易放弃对“命运之瞳”的争夺。
“我们不能把‘命运之瞳’一直留在这个神社密室里，黑衣组织肯定还会想尽办法再来抢夺。”柯南紧皱眉头，望着石棺中的“命运之瞳”说道。
“没错，而且这里已经暴露，对‘命运之瞳’来说不再安全。但我们要把它转移到哪里去呢？”灰原哀也陷入沉思。
毛利小五郎摸着下巴，思索片刻后说：“或许可以把它交给警方，警方有专门的证物保管库，应该能提供一定程度的保护。”
柯南却摇了摇头：“不行，叔叔。黑衣组织势力庞大，渗透极深，难保警方内部没有他们的眼线。把‘命运之瞳’交给警方，反而可能让它陷入更大的危险。”
众人一时陷入沉默，都在苦思冥想安全转移“命运之瞳”的办法。这时，光彦突然开口：“柯南哥哥，我们能不能找一个绝对安全又隐蔽的地方，比如阿笠博士家的地下室，那里有很多博士发明的高科技防御设施。”
阿笠博士挠了挠头：“虽然我家地下室确实有不少防御装置，但黑衣组织对我也有所关注，难保他们不会猜到我们把‘命运之瞳’藏在那里，一旦被发现，在居民区发生冲突，后果不堪设想。”
元太着急地跺脚：“那可怎么办呀？总不能眼睁睁看着黑衣组织来抢走它。”
步美也忧心忡忡：“柯南哥哥，你快想想办法嘛。”
柯南沉思良久，脑海中突然灵光一闪：“有了！我们可以利用铃木集团的力量。铃木园子的父亲铃木史郎，他旗下有许多高科技安保设施的建筑，而且铃木集团与警方也有密切合作，能够调配更多的安保资源。更重要的是，黑衣组织应该很难想到我们会把‘命运之瞳’交给铃木集团保管。”
众人听后，都觉得这是目前相对可行的办法。于是，柯南立刻联系了铃木园子，简单说明了情况，园子表示会马上和父亲商量。很快，园子回复说铃木史郎同意帮忙，并安排了一支精锐的安保队伍前来红叶村接应。
在安保队伍的护送下，柯南等人小心翼翼地将“命运之瞳”从石棺中取出，转移到一个特制的保险箱内，运往铃木集团旗下的一座高度机密的地下保险库。保险库位于一座大型商业建筑的地下深处，四周墙壁由高强度合金打造，配备了最先进的指纹识别、虹膜扫描以及多重密码验证系统，还有24小时不间断的巡逻安保人员。
“命运之瞳”安置妥当后，柯南等人并没有放松警惕。他们知道，黑衣组织必定会展开新一轮的调查，试图找出“命运之瞳”的下落。为了引出黑衣组织的下一步行动，同时也为了进一步了解他们的计划，柯南决定故意放出一些假消息，误导黑衣组织。
柯南通过一些秘密渠道，散布出“命运之瞳”被转移到米花市郊外一处废弃工厂的消息，并且安排了一些看似可疑的人员在废弃工厂附近出没，制造出正在秘密守护“命运之瞳”的假象。
与此同时，柯南、灰原哀和阿笠博士在毛利侦探事务所内，对之前搜集到的所有线索进行了全面而深入的梳理。他们将从废弃矿场、星耀科技、地下设施以及红叶村神社得到的信息一一罗列，试图找出黑衣组织计划中尚未被发现的关键环节。
“你们看，从这些线索来看，黑衣组织的每一步行动都围绕着获取强大的力量，而‘命运之瞳’似乎是他们计划的核心关键，但他们为什么如此执着于打开那个神秘世界的大门呢？”灰原哀指着桌上的资料说道。
柯南托着下巴，沉思道：“也许那个神秘世界中存在着某种能让他们实现统治世界野心的东西，可能是一种无敌的武器，或者是一种可以控制人类思想的神秘力量。”
阿笠博士推了推眼镜：“不管是什么，都绝不能让黑衣组织得逞。对了，关于赤井秀一身上的纹身，我通过一些特殊渠道咨询了几位符号学权威专家，他们认为这个纹身可能代表着黑衣组织内部一个高级别的身份或者职位，而且与他们的核心机密有着紧密联系。”
“这么说，赤井秀一很可能掌握着我们所不知道的黑衣组织关键信息。但他现在的状态很奇怪，我们该怎么从他那里获取线索呢？”柯南陷入了沉思。
就在这时，柯南的手机收到了一条匿名短信：“想知道真相，今晚十点，米花港废弃码头，独自前来。”柯南看着短信，心中明白这很可能与黑衣组织有关，也有可能是赤井秀一再次传来的消息。
“我要去赴约，看看对方到底想干什么。”柯南说道。
“太危险了，柯南。这很可能是个陷阱。”灰原哀担忧地说道。
“我知道，但这也许是我们揭开黑衣组织秘密的重要机会。放心吧，我会小心的。”柯南坚定地说道。
晚上十点，柯南准时来到米花港废弃码头。月光洒在破旧的码头上，海浪拍打着岸边，发出沉闷的声响。四周一片寂静，只有远处几盏破旧的路灯散发着微弱的光芒。
柯南警惕地观察着周围的一切，缓缓走向码头中央。突然，一个黑影从一艘废弃的货船后闪现出来。
“你终于来了，柯南。”黑影的声音低沉而沙哑，正是之前以赤井秀一模样出现的人。
“你到底是谁？为什么一直以赤井秀一的样子出现？又为什么给我发这些信息？”柯南毫不畏惧地盯着黑影问道。
黑影缓缓走近，月光照亮了他的脸庞，果然是那张与赤井秀一极为相似却又透着诡异的脸。
“我是谁并不重要，重要的是，你想不想真正了解黑衣组织的核心计划。”黑影冷笑道。
“少废话，有什么就直说。你们到底有什么阴谋？”柯南愤怒地说道。
黑影从怀中掏出一个小型的记忆芯片，扔给柯南：“这里面有你想要的答案，但你要知道，知道得越多，你面临的危险就越大。”
柯南接住芯片，质问道：“你为什么要给我这个？你到底有什么目的？”
黑影没有回答柯南的问题，转身准备离开：“一切答案都在芯片里，你自己去看吧。但记住，黑衣组织不会放过任何阻挡他们的人，你已经身处绝境，好自为之。”
说完，黑影迅速消失在黑暗中。柯南紧紧握着手中的芯片，心中充满了疑惑和警惕。这个芯片里到底隐藏着怎样的秘密？黑衣组织又在谋划着什么更加可怕的阴谋？柯南深知，自己已经踏入了一个更加危险的漩涡，但为了阻止黑衣组织，他没有退缩的余地。回到毛利侦探事务所，柯南将芯片插入电脑，随着电脑屏幕上数据的读取，一系列惊人的信息展现在他面前，而这些信息，将彻底颠覆他们对黑衣组织的认知，一场更为惊心动魄的较量即将拉开帷幕.....