阳光透过斑驳的树叶，洒在米花市医科大学的校园里，然而这宁静的氛围却被一声惊恐的尖叫打破。
柯南、灰原哀和毛利小五郎受医科大学教授之邀，来参加一个医学研讨会。就在他们准备进入教学楼时，听到了从解剖室方向传来的尖叫。
柯南和毛利小五郎立刻冲向解剖室，灰原哀也紧跟其后。只见解剖室里，一名女学生瘫坐在地上，手指颤抖地指着解剖台，解剖台上赫然是一具无头女尸，鲜血染红了台面，场面十分恐怖。
“啊，这……”毛利小五郎也不禁倒吸一口凉气。
柯南迅速冷静下来，开始勘查现场。他发现尸体的切口很整齐，应该是被锋利的刀具所切。而且尸体周围有一些奇怪的脚印，似乎是凶手留下的。
灰原哀在一旁仔细观察着尸体，她发现尸体的身上有一些奇怪的符号，像是某种神秘的标记。
“柯南，你看这些符号，好像不是普通的记号。”灰原哀说。
柯南点点头：“嗯，看来这个案件不简单。凶手为什么要把尸体的头砍掉，还留下这些符号呢？”
这时，目暮警官带着警察赶到了现场。
“毛利老弟，又是你啊。这次的案件看起来很棘手啊。”目暮警官说。
毛利小五郎摸着下巴：“是啊，目暮警官，我们正在调查。”
经过询问，他们得知死者是医科大学的一名研究生，名叫林美。林美平时学习成绩很好，为人也很和善，没有什么仇人。
“那凶手为什么要杀她呢？”步美害怕地问。
元太在一旁说：“会不会是有人嫉妒她的才华？”
光彦摇摇头：“不太可能，嫉妒也不至于杀人啊。”
柯南和灰原哀继续在校园里调查，他们发现林美最近在研究一个关于人体基因的项目，这个项目似乎引起了一些人的不满。
“难道是因为这个项目，所以她才被人杀害？”柯南推测道。
灰原哀说：“很有可能，我们再去林美的实验室看看。”
在林美的实验室里，他们发现了一些被破坏的实验设备和一些丢失的资料。
“看来凶手是为了这些资料才杀了林美。”柯南说。
正当他们准备进一步调查时，突然有人从背后袭击了他们。柯南和灰原哀连忙躲避，发现袭击他们的是一个戴着面具的人。
“你们不要多管闲事，否则下一个死的就是你们。”面具人说完就跑了。
“别跑！”柯南追了上去，但面具人跑得太快，很快就消失在了校园里。
“可恶，让他跑了。”柯南气愤地说。
灰原哀冷静地说：“柯南，别追了。我们还是先整理一下线索吧。”
回到解剖室，柯南和灰原哀再次仔细观察尸体，他们发现尸体的头部似乎是被一种特殊的工具砍掉的，这种工具在普通的市场上很难买到。
“这种工具很可能是专业的医学器械，我们可以从这方面入手调查。”灰原哀说。
柯南点点头：“嗯，我去问问医科大学的老师和学生，看看有没有人知道这种工具。”
经过一番调查，柯南终于找到了一个线索。有一个学生说，他曾经看到一个神秘的人在学校的仓库里拿了一些奇怪的工具，那个神秘人看起来很可疑。
“我们去仓库看看。”柯南带着灰原哀来到了学校的仓库。
在仓库里，他们发现了一些血迹和一些被丢弃的工具，这些工具正是用来砍掉尸体头部的。
“看来我们找对地方了。”柯南说。
就在这时，他们听到了一阵脚步声。柯南和灰原哀连忙躲了起来，只见一个人走进了仓库。这个人正是医科大学的一位教授，他们之前在研讨会上见过。
“原来是他。”灰原哀小声地说。
柯南和灰原哀悄悄地跟着教授，发现他来到了一个秘密的地下室。在地下室里，他们看到了一些令人震惊的场景，原来教授一直在进行非法的人体实验，林美发现了他的秘密，所以他才杀了林美。
“这些人简直太可恶了，为了自己的利益，竟然做出这种事。”柯南愤怒地说。
灰原哀说：“我们现在要做的就是找到证据，把他绳之以法。”
经过一番努力，柯南和灰原哀终于找到了教授进行非法人体实验的证据。他们把证据交给了目暮警官，警方立刻采取行动，将教授逮捕。
这起医科大学无头女尸案终于告破，柯南和灰原哀又一次用他们的智慧和勇气，维护了正义。
“希望以后不要再有这样的案件了。”灰原哀看着远方说。
“嗯，我会努力让这个世界变得更美好。”柯南坚定地说。
少年侦探团的小伙伴们也对柯南和灰原哀的表现赞不绝口，他们又一起回到了平静的生活中，但柯南和灰原哀知道，未来还会有更多的挑战等着他们。