暗物质空洞爆发的能量风暴如同一头苏醒的远古凶兽，将本草星舰与熵兽舰队一同卷入扭曲的时空乱流。秦逸的意识在维度裂隙中剧烈震荡，他的基因共鸣能力不受控制地疯狂运转，皮肤表面的星图纹路如同燃烧的火焰般明灭不定。“坚持住！”林婉的声音穿透混乱，烧火棍散发出温润的光芒，试图稳定众人的意识。但时空乱流中不断涌现的记忆碎片如锋利的刀刃，切割着每个人的精神防线。
秦青鸾的时空针灸舟在乱流中艰难穿行，仪表盘上的指针疯狂旋转，所有导航系统全部失灵。突然，舷窗外闪过一道熟悉的身影——是年轻时的初代仙医，他身着白大褂，眼神中还带着未被疯狂侵蚀的纯粹。“这是...时空残影？”秦青鸾握紧操纵杆，试图捕捉残影中的线索，却发现残影化作无数萤火虫般的光点，钻入针灸舟的操作系统。
星孩在大黄舰的主控室里，与灵枢一同对抗着乱流带来的数据污染。“检测到未知时空坐标！”灵枢的警报声中夹杂着电流杂音，“我们正在被传送到...寒武纪时期的地球！”话音未落，本草星舰的舷窗外，巨大的奇虾与怪诞虫游过，古老的海洋散发着诡异的磷光。更可怕的是，星舰的经络系统开始出现紊乱，当归舰的补血能量与大黄舰的攻毒能量产生冲突，仿佛在重演远古时期的“水火不容”。
林婉的烧火棍突然变得滚烫，她通过共情之力感受到了时空乱流中隐藏的恶意。“这不是意外！”她的声音带着愤怒，“是熵兽残党在时空节点设下的陷阱，他们想让我们在混乱中湮灭！”此时，秦逸的意识突然被一股神秘力量牵引，他看到了平行宇宙中无数个“星穹医盟”的结局——有的被熵兽彻底吞噬，有的在自相残杀中毁灭，还有的选择与熵兽融合，成为新的威胁。
在寒武纪的海底，本草星舰遭到了一种古老病毒的攻击。这种病毒形似中医典籍中记载的“疠气”，能够快速分解生物的基因链。星孩紧急调取《瘟疫论》的数据，试图找到克制方法，却发现病毒的结构在不断进化，每一次攻击都会产生新的变异。“必须找到病毒的源头！”他大喊道，“就像中医治病，要釜底抽薪！”
秦逸的基因共鸣能力在此时与寒武纪的生命产生了奇妙的共鸣。他发现，这种病毒并非自然产生，而是某个高等文明在远古时期进行的“生命筛选实验”残留。“我们要改写历史！”他的声音坚定，“但直接消灭病毒会引发蝴蝶效应，必须用针灸跃迁技术，在不改变大趋势的前提下，引导病毒进化方向！”
林婉立即指挥两艘本草星舰组成“子午流注阵”，利用时间流速的差异，在病毒扩散的关键节点进行干预。秦青鸾驾驶针灸舟化作一根“时空银针”，刺入病毒的核心区域。当金色的能量注入远古海洋的瞬间，秦逸看到了生命进化树的微妙改变——原本会灭绝的某些物种得以延续，而病毒也逐渐失去了对高等生命的威胁性。
然而，就在众人以为危机解除时，时空乱流再次加剧。一个巨大的黑色漩涡出现在星舰前方，漩涡中传来熵兽首领的冷笑：“你们以为能轻易改写历史？真正的好戏，才刚刚开始...”漩涡将本草星舰吸入其中，当众人再次睁开眼时，发现自己来到了一个科技与修真并存的奇异世界，这里的天空漂浮着巨大的丹炉，地面上的修士们使用着融合了中医理论的法术，而远处的城池上，竟飘扬着熵兽的旗帜。