宇宙在守护者们的努力下重归平静，星穹联盟举行了盛大的庆典，各个文明将守护者们的事迹镌刻在星辰之间。机械帝国用量子合金打造了一座巨大的守护者雕像，魔法星系以元素之力编织出赞颂他们的史诗，科技联邦则将这场战斗的数据上传至宇宙档案馆，供后世研究。世界树的根系再次生长，绽放出璀璨的「希望之花」，根系延伸之处，荒芜的星系也开始焕发新生。然而，在宇宙最黑暗的角落，神秘粒子虽然消散，却留下了不可忽视的「量子残渣」。
林羽在世界树顶端的了望台擦拭星痕剑时，剑身突然渗出黑色雾气，剑上的符文发出微弱的红光。树灵的意识碎片再次闪现：「残渣...正在重组...新的危机...即将降临...」了望台的时空坐标开始紊乱，窗外的星辰扭曲成诡异的形状，仿佛在预示着不祥。
沈梦璃在虹桥网络的中枢进行日常维护时，发现部分节点出现了异常的数据流。当她深入探查，意识瞬间被拉入一个由破碎代码组成的「数字炼狱」。在这里，她看到无数被篡改的文明记忆——机械帝国的历史被篡改成征服宇宙的血腥史，魔法星系的传说变为黑暗魔法的颂歌，科技联邦的成就沦为奴役生命的工具。「这不是简单的数据损坏，」她的精神体泛起裂纹，「是量子残渣在侵蚀文明的集体记忆！」
雷掣在寰宇织机的核心实验室中，监测到量子残渣的能量波动与宇宙的暗物质产生了诡异共鸣。他将数据输入超维沙盘，模拟出的结果令人不寒而栗：当共鸣达到峰值，宇宙的时空结构将发生不可逆的扭曲，所有文明的存在都将被彻底改写。更可怕的是，他在系统底层发现一段名为「记忆重构协议」的程序，其代码能将量子残渣的能量转化为篡改现实的力量。
洛凛带领的星穹守望者在巡逻时，遭遇了由量子残渣孕育出的「记忆吞噬者」。这些怪物形似扭曲的黑洞，所过之处，文明的历史遗迹瞬间消失，仿佛从未存在过。一名守望者试图用武器攻击吞噬者，却发现自己的记忆正在被快速抽取，连存在过的痕迹都逐渐模糊。共生之刃在洛凛手中剧烈震动，刀刃映出的倒影里，他看到自己的记忆也在被蚕食。
伊璇融入世界树的生命能量突然变得紊乱，她在根系深处发现了被黑色雾气包裹的「记忆孢子」。孢子释放的气体能渗透世界树的每一个角落，将「希望之花」转化为散发诡异光芒的「遗忘之花」。世界树的树皮渗出腐蚀性液体，所到之处，文明的历史传承开始瓦解，人们逐渐忘记曾经的荣耀与坚守。「这些孢子...正在抹杀文明的根基...」伊璇的声音带着恐惧，「我们必须阻止它们！」
守护者们紧急集结，全息星图上，量子残渣形成的暗物质云团如同一只巨大的触手，正在向各个文明蔓延。「这次的危机比以往更加棘手，」林羽握紧星痕剑，剑上的黑雾与光芒激烈对抗，「它攻击的是文明的根源——记忆与传承。」沈梦璃将精神探测到的记忆篡改场景投影出来，雷掣展示着「记忆重构协议」的数据模型，洛凛描述着记忆吞噬者的恐怖特性，伊璇捧着记忆孢子，凝重的气氛让整个指挥室陷入死寂。
宇宙的夜幕下，量子残渣的暗物质云团汇聚成一座由扭曲记忆构筑的「遗忘圣殿」。圣殿的墙壁上流动着被篡改的文明历史画面，十二个黑色法球悬浮在空中，每个法球都散发着能抹除记忆的能量。一个由黑雾与破碎记忆碎片交织而成的身影缓缓现身，它的声音混杂着无数文明的悲鸣：「守护者们，你们的文明终将在遗忘中消亡。记忆是如此脆弱，而我...是遗忘的化身。」
林羽等人驾驶着经过记忆强化的「星穹号Ψ - 6」冲向遗忘圣殿，星舰的防护罩在接触量子残渣能量的瞬间，开始将船员的记忆转化为虚无。沈梦璃的精神力构建起多层记忆防线，却发现记忆吞噬者能通过情感共鸣发动攻击；雷掣操控量子引擎试图稳定时空结构，引擎却不断接收到「记忆重构协议」的指令；洛凛挥舞光刃砍向圣殿，光刃每次接触黑雾都会崩解成记忆碎片；伊璇将生命能量注入星舰核心，能量却被转化为强化记忆孢子的养料。
星痕剑在林羽手中剧烈震颤，剑上的符文与「遗忘圣殿」产生共鸣。林羽的意识被强行拉入一个由破碎记忆组成的超维空间，在这里，他看到了文明在遗忘中的千万种结局——有的被彻底抹去存在痕迹，有的在虚假记忆中迷失，还有的...在记忆的废墟中寻找真相。而在所有可能性的尽头，那个黑雾身影正狞笑着，等待着文明坠入遗忘的深渊...
在这千钧一发之际，林羽突然想起初代守护者留下的典籍中关于「记忆传承」的记载。他集中精神，将自己对文明的热爱、对伙伴的信任，以及全宇宙生命的记忆碎片全部注入星痕剑。剑身上的红光愈发耀眼，逐渐驱散了周围的黑雾。与此同时，沈梦璃在虹桥网络中找到了「记忆重构协议」的漏洞，她利用精神力构建了一个反向程序；雷掣则在寰宇织机上开发出能中和量子残渣能量的装置；洛凛带领守望者们用信念组成防线，抵御记忆吞噬者的进攻；伊璇将生命能量化作净化之光，试图驱散记忆孢子。
守护者们能否突破遗忘圣殿的重重阻碍，成功拯救文明的记忆？被篡改的历史又能否恢复原状？一场关乎文明存续的终极记忆之战，正在惊心动魄地展开...