第二天，熊廷弼安排人带着前去各地接防的京营军队出发了，同时朱由校也把他和孙承宗叫了过来。
“这次大战规模大，从现在开始坚壁清野，除了长宁堡、虎皮驿等几个大的堡垒，其他的小堡垒全部放弃，城外百姓全部就近迁入城里。”
“陛下，这样的话，粮草可能不够！”熊廷弼说道。
“朕都已经准备好了，接下来会有粮食源源不断的送到各城，你们不用担心，快去准备吧，一定要在敌人进攻之前完成。”
“臣遵旨！”熊廷弼和孙承宗答道。
就这样过了三天，城外正在坚壁清野忙的厉害，这时候辽东各地将领也都到了沈阳，第二天，朱由校召集了所有人。
“这次建奴和蒙古人同时来攻，规模庞大，朕御驾亲征，各位可得好好配合。”
“陛下放心，臣等遵旨！”
“嗯，在这之前，朕还有些事要处理。朕登基后，让锦衣卫好好的查了一下，诸位在辽东干的好大的事，北结建奴，西联蒙古，真是厉害！”
下面的人听完脸色都白了，这时大批锦衣卫从外面冲了进来，将所有人都围了起来，长刀出鞘，冷冷的看着这帮人。
“陛下，冤枉啊，臣等一直为朝廷尽忠，定是锦衣卫冤枉我等！”
“冤枉？从李成梁开始，你们这些辽东将领就在养寇自重，等李成梁那个王八蛋死了，你们也学着他的本事了，建奴缺地盘你们就退守，缺武器你们就送武器，缺粮食你们就走私粮食，然后以此向朝廷要军饷，当军阀，竟然还敢说冤枉？”
“当朕是个傻子？辽东被你们害死的几十万汉人的冤魂看着你们呢，朕不处理了你们怎么对得起他们？”
“来人，按名单抓人，全部锁拿下狱！”
听到朱由校的话，下面的锦衣卫立刻冲了上去，这些将领进来之前都交了武器，有两个想反抗，直接被锦衣卫砍死了，其他人很快被拿下了。
“陛下现在抓了我们，等消息传出去，整个辽东都会大乱，到时候开心的可就是建奴和蒙古人了，陛下不怕吗？”祖大寿红着眼睛说道。
“怕？你当你们和那些朝堂上的文官准备出卖朕，朕会不知道？太高看你们了，都带下去！”
这一波屋子内被带出去超过六成人，基本都是辽东本地将领，只有少数几个其他地方来支援的。
堂下剩下的人目瞪口呆，谁也没想到会这样。熊廷弼连忙道:“陛下，您刚才说有人要出卖您，这是真的吗？”
“当然，锦衣卫都查清楚了，不然你们以为为什么蒙古人和建奴联合起来了，有人出了大价钱想要朕的命。”
“不好，陛下还请立刻回京，这些人被抓了，辽东会出乱子的，到时候建奴和蒙古人来了，就出大事了！”孙承宗急了，他也没想到会出这样的事。
“是啊，陛下，还请陛下立刻由京营护送回京城，臣等誓死挡住敌人！”
下面的其他人也急了，他们对大明朝还是忠心的，生怕皇帝会出事。
“都不用担心，朕既然知道他们的阴谋，岂能没有准备。”
“除了京营，还有两营军队秘密抵达辽东，而且朕之前派去各地的军队现在应该已经控制住了各地，你们不用担心，回去好好准备大战就可以了，接下来朕会整顿辽东军队，你们注意配合。”
“是！”众人看朱由校一副尽在掌握中的样子，也不好再说什么，只能心事重重的下去了。
事情也和朱由校说的一样，各地接管还算顺利，那些千户之下的军官有问题的都被抓了，其中倒是有人反抗，但都规模不大，很快被镇压了。
底层士兵听到有皇帝圣旨后，就没什么反抗了。如果那些将领还在，他们或许会听那些将领的，可现在都不在，他们当兵都是为了混口饭吃，可不敢造反。
之后几天，朱由校兑换了大量低层军官，对辽东军队进行了大整编。
现在这个时候，辽东驻军加上各地援辽军有二十多万人，不过去了吃空饷的，大概还有个十几万人，朱由校从中挑选了四万精锐组建了两个营，又挑了三万人组成六个后备卫所，作为以后辽东各地方守军。
这些加上朱由校之前秘密召唤的两个营，组成辽东驻军。毕竟建奴没灭了之前，辽东还是要驻扎重兵。
其他辽东军队都遣散为民，本地的就发放土地编为民户，外地的愿意留在辽东的就一样发放土地，其他人先当作后勤，战后再回内地。
至于发放的地哪来的，当然是抄家来的，而且趁着这个机会，朱由校解散了辽东所有军户，全部变成平民，都每家发放土地，不过这些工作很多，想要全部完成估计还要很长时间。
不过现在辽东百姓都沸腾了，辽东是军镇，大部分都是军户，日子过的那是真的苦，现在不用做军户了，当然高兴了。
因为是边关军镇的原因，辽东士绅不多，商人倒是不少，不过这些人大部分都和辽东将领有勾，做走私的非常多，锦衣卫在军队的配合下，全部都抓了，所以朱由校分土地也没什么阻力。
过了十多天，辽东军队重组好了，虽然还没完全磨合好，但换了新装备后，战斗力比之前更强。
辽东四个营的主官，贺世贤任辽东第一营都指挥使，赵率教任第二营都指挥使，满桂任第三营都指挥使，第四营指挥使是系统人员，其他将领依次为各卫指挥使、指挥同知之类的。
因为底层军官都是朱由校的人，所以他也不怕控制不住。
除了留下第四营配合后备卫所守卫各地，其他三营和京营都集结到了沈阳周边。
“俺老贺还是第一次见到装备这么好的军队。”
赵率教接话道:“是啊，我那一个营有近一百门火炮，近万支火铳，而且那火铳打的又远，威力又大，而且还不会炸膛。火炮也是比以前的好，威力大，射的远，还轻了许多。”
满桂点了点头，“是啊，而且士兵全部披甲，这次要好好给建奴放放血！”