元朝元末皇帝妥懽帖睦尔至正二十年（1360年），朱元璋在梦中得到济公活佛的指引，把学识渊博的刘伯温请到了应天（今南京），委任他为谋臣。刘伯温针对当时之形势，向朱元璋提出了避免两线作战、各个击破的建策，被朱元璋所采纳。
刘伯温完成了“高筑墙”的部署之后，朱元璋便着手实行“广积粮”的计划。
为了解决粮食问题，朱元璋除了动员百姓进行生产外，决定推行屯田法，大力开展军队屯田，任命元帅康茂才为都水营用使，负责兴修水利，又分派诸将在各地开垦种田。
公元1361年， 辛丑年（牛年）；元至正二十一年；韩林儿龙凤七年；陈友谅大定二年；越南大治四年；日本南朝正平十六年，北朝延文六年，康安元年。
正月，小明王封朱元璋为吴国公。二月，吴立盐法，令商人贩卖，二十取一；立茶法，商人在产茶郡县缴钱领茶引，方许出境贸易。吴铸大中通宝钱，与历代钱并行。五月，宋将李武、崔德降李思齐。七月，元察罕帖木儿大举进攻山东。陈友谅将张定边陷吴安庆；李明道攻吴信州，大败被俘。
八月，朱凶平率徐达、常遇春等西上，收复安庆，进破江州。陈友谅退往武昌，部将丁普郎、傅友德降吴。察罕帖木儿陆续攻下山东各地，宁田丰、王士诚以东平、济宁降察罕，朱元璋畏察罕，遣使“通好”。十月，察罕帖木儿陷济南，进围益都，守将陈猱头拒之。
十一月，吴常遇春援长兴。时张士诚将李伯升围长兴已月余。常遇春兵至，李伯升弃营走。朱元璋占领池州、江州、泗州，西征陈友谅，被小明王韩林儿封为吴国公。朱元璋于应天府设宝源局，掌管铸钱之事。
元朝元末皇帝妥懽帖睦尔在位的至正二十二年（公元1362年），这一年是让朱元璋感到很心烦郁闷的日子，因为在这一年之中朱元璋不仅被东西频发的叛乱所困扰，还被张士诚和陈友谅不时发动的进攻所擎制。内忧外患的局面让朱元璋疲于应对，因而在开疆拓土的行动上面并没有能取到什么成果。
二月初七日，叛乱首先在东线爆发。金华苗军元帅蒋英、刘震、李福叛乱，杀害了镇守金华的参政胡大海、郎中王恺、总管高子玉，举金华而叛。
金华全城被叛军所占据，整个浙东中书分省无疑都受到了震动。
金华城中，躲过一劫的典史李斌知道情况紧急，于是“怀省印，缒城走严州，告变于朱文忠（即李文忠）”。李文忠听说金华叛乱，立即派遣元帅何世明、掾史郭彦仁等人率军讨伐金华。
何世明兵至兰溪，蒋英知道自己不是对手，于是驱掠城中子女向西投降了张士诚，何世明得以顺利进入金华。此时，还在城中的张斌、吴德珍再次至何世明马前请降。何世明知道王恺死于吴德珍之手，想要杀了他，张斌力劝何世明说：“杀一得珍则降者皆惧，后人不复来降矣！”吴德珍才捡回一条命，金华之乱被平定了下来，胡大海的养子胡德济也终于得以为养父奔丧，朱元璋称帝后大封功臣时追封胡大海为越国公以示纪念。
胡大海被杀，金华不能无人镇守，于是朱元璋命左司郎中杨元杲前往金华总理军储，李文忠也亲自前往金华安抚军民。当李文忠进入金华的时候，其“父老遮道诉曰：“士民不幸遭叛寇屠戮，日夜望王师以解倒悬，今将军至，吾属无患矣！”
在李文忠的亲自主持之下，金华地区终于又安定了下来，朱元璋于是改浙东中书分省为浙东等处行中书省，升同佥李文忠为浙东行省左丞。
金华之乱让朱元璋失去了包括胡大海在内的一批重要将领，也造成了整个金华地区的骚动，但好在没有让金华落入敌手。李文忠以大军压境，金华很容易地就收复了。
至正二十三年（公元1363年）四月，在朱元璋率领主力大军亲援安丰，徐达、常遇春大战庐州城之时，陈友谅决定孤注一掷，向朱元璋发动了最后一次大规模的进攻。
很快，陈友谅的大军就进抵洪都城下！
面对声势浩大的汉军，朱文正并没有丝毫的畏惧，相反他表现得异常镇定。
他命令邓愈、牛海龙等将领各自进入到自己的阵地，自己则亲率两千精兵前来策应。
激战没几天，抚州门就被汉军攻破，邓愈命令部下以火铳击退汉军，并迅速构筑起木栅，抵御汉军的进攻。
汉军凭借着人多的优势，涌上来抢夺木栅，朱文正督军死战，且战且筑，仅一个晚上的时间，就重新构筑起了城墙。
连续进攻了几十天，汉军损失惨重，但却仍未将洪都城攻下。
尽管陈友谅万分焦急，但也无可奈何，只好整日研究对策，准备继续进攻。
朱文正也知道，自己兵少将寡，且后勤补给严重不足，如果没有援军的话，洪都城陷落也就是时间的问题。
于是，朱文正决定派千户张子明连夜乘小船秘密潜出敌营，向朱元璋求救。
元顺帝至正二十四年（1364年）正月，朱元璋自称为吴王，仍用宋龙凤年号，二月，朱元璋至武昌督战，城破，围攻凡六个月，陈理率张定边等降。而这个时候，元朝朝廷的当今皇帝元顺帝妥懽帖睦尔与皇太子争权，二人各结其外援。
三月，右丞相搠思监等（太子派）用诏书解除孛罗帖木儿兵权，孛罗拒命。
四月，搠思监等命扩廓帖木儿讨伐孛罗帖木儿。孛罗帖木儿率兵逼大都，元顺帝捕搠思监与宦官扑不花交孛罗，孛罗杀二人。朱元璋命徐达等再攻庐州，左君弼逃往安丰，吴兵围庐州。朱元璋命商税三十取一；在江西设货钱局铸钱，名大中通宝，分大小五等。五月，扩廓帖林儿攻孛罗帖林儿，派关保等进逼大同。孛罗帖木儿攻大都。七月，吴军攻克庐州。元皇太子兵败，逃往扩廓军中，孛罗帖木儿入大都。八月，元顺帝妥懽帖睦尔任命孛罗为中书右丞相，节制天下军马。
是年，朱元璋陆续攻克两湖、江西原陈友谅所属地。各地多望风迎降，惟熊天瑞守赣州，拒常遇春，从八月至次年正月，始力尽而降。是年，张士诚浚常熟白茆港。
至正二十五年（1365年）七月二十九日，孛罗帖木儿入宫时被杀手伯颜达儿等刺杀于延春阁李树之下。刺杀行动进行时，妥懽帖睦尔躲在密室内，约定事成则放鸽铃声。听到鸽铃声后，妥懽帖睦尔走出密室，下令民间杀尽孛罗帖木儿的部下（即所谓“川军”），同时命人将孛罗帖木儿的人头装进匣子里，送到太原的皇太子之处。
至正二十五年（1365年）的九月，扩廓帖木儿护送皇太子还京，元末皇帝妥懽帖睦尔任命其老臣伯撒里为右丞相，扩廓帖木儿为左丞相，宫廷内斗告一段落。
而后，元朝末代皇帝妥懽帖睦尔又封扩廓帖木儿为河南王，南下肃清江淮，不料却引发了扩廓帖木儿与李思齐、张良弼等诸多军阀在河南、山西、陕西等地混战的局面。元朝末皇帝妥懽帖睦尔怀疑扩廓帖木儿有异志，于是命皇太子爱猷识理达腊总领天下兵马，开大抚军院，讨伐扩廓帖木儿。
这场军阀混战一直持续到大都失守前夕，极大损耗了元朝的有生力量。元朝皇帝妥懽帖睦尔虽然昏庸，但亦知国难当头，在至正二十七年（公元1367年）秘密在高丽济州岛建造宫殿，以备将来逃难之用。
在元朝内乱的期间内，朱元璋坐大于南方，将陈友谅、张士诚、方国珍等群雄次第削平，并在至正二十七年（1367年）十月发动“驱逐胡虏、恢复中华”的北伐战争。至正二十八年（1368年）正月，朱元璋自称皇帝，国号大明，建元洪武。
至正二十八年（公元1368年）闰七月二十三日，明朝军队抵达直沽，二十六日，知枢密院事卜颜帖木儿出大都迎战明军，被擒杀，太庙牌位也被收集好，在逃难的时候一起带走。
二十七日，元朝最后的皇帝妥懽帖睦尔命令淮王帖木儿不花监国，庆童为中书左丞相，而自己则是做好了逃难的准备。
二十八日，这个元朝最后的皇帝妥懽帖睦尔驾临到大都清宁殿，召见了众臣及三宫后妃与皇太子，正式宣布将逃往上都。知枢密院事哈剌章（脱脱之子）力谏不可，妥懽帖睦尔说：“也速已败，扩廓帖木儿远在太原，何援兵之可待也？”
宦官赵伯颜不花跪地痛哭进谏说道：“天下者，世祖之天下，陛下当以死守，奈何弃之！臣等愿率军民及诸怯薛歹出城拒战，愿陛下固守京城！”妥懽帖睦尔叹息说：“今日岂可复作徽、钦！”
到了这天夜里，大都健德门开，妥懽帖睦尔与皇太子、后妃及一百多名大臣出奔上都。妥懽帖睦尔一路上如惊弓之鸟，连山峰塌方都以为是明军到来。
八月十五日，妥懽帖睦尔一行终于抵达到了元上都（解说—位于内蒙古自治区锡林郭勒盟正蓝旗上都镇，地处闪电河畔金莲川草原之上，南临上都河），而此前大都已经在八月二日被明军攻占，监国淮王帖木儿不花等殉国。
元朝在中原的统治宣告结束，北元时代开始。
至正三十年（1370年），元朝皇帝妥懽帖睦尔病重，由皇太子爱猷识理达腊总揽军国诸事。
同年四月二十八日（1370年5月23日），妥懽帖睦尔因痢疾驾崩于应昌，享年五十一岁，太尉完者、院使观音奴奉梓宫北葬。死后的庙号叫做惠宗。
明太祖朱元璋以其“知顺天命，退避而去”，给予了妥懽帖睦尔“顺帝”的谥号。
蒙古汗号“乌哈笃汗”（一作乌哈噶图汗，意为明智的）。