而在玛纳斯的李成梁等人，也在积极的商量应该怎么对付蒙古人，李成梁率军屯兵玛纳斯，主要是为了保护大明的屯田，同时观察蒙古人的动向，当蒙古大军开始东进的时候，李成梁召集众将，李成梁决定向西进兵，进占奎屯河以西，和蒙古人形成对峙之势。
李成梁之所以要西进奎屯河，一方面是为了保护朝廷在玛纳斯的屯田，另一方面就是逼迫蒙古人主动出战，因为蒙古人从精河而来，到奎屯河一共三百八十里，一路之上只有一条古尔图河可以为蒙古人提供水源，而古尔图河发源于天山北麓，发源于博罗科努山，由五条支流汇成，流经古尔图镇、牧场等地，最终与奎屯河、四棵树河汇入艾比湖，水流量不大，要是官军扼守住奎屯河，这八万蒙古军队和他们的牲畜的饮水，都将会是极大的麻烦，李成梁此举，意在逼迫蒙古人主动出击。
麻贵等人也同意李成梁的这个判断，官军随后以五万之众拔营起寨，抢在蒙古人之前渡过奎屯河，控制水源，然后再次扎营，而蒙古人也已经渡过了古尔图河，两军的尖哨开始接触，当得知官军已经抢先占据了奎屯河之后，蒙古人是极为惊讶的，因为从古尔图河到奎屯河，正好二百里路程，说远不远，说近不近，这个距离对于蒙古人来说是很难受的。
因为一路上是没有河流为蒙古军队提供饮水的，蒙古人尚且可以依靠水囊等携带饮水，但是战马等牲畜的饮水就有些困难了，蒙古人又没有水车等运水工具，即便是骆驼能够耐饥渴但是也是需要饮水的，这点蒙古人是很清楚的，所以蒙古人先在古尔图河扎营，商讨下一步的行止。
准噶尔部的看法是很简单的，就依靠蒙古人自己所携带的饮水，快速击败官军，将官军赶到奎屯河以东去，蒙古人就可以利用奎屯河的水源了，但是这就存在一个极大的问题，西域的蒙古人饲养的马匹数量不多，所以他们多是步骑混编甚至还有不少骆驼，步兵显然是跟不上骑兵的速度的，要快速接近官军，就必须集中骑兵进军，这样势必会导致蒙古军队步骑脱节，削弱蒙古人的兵力优势。
这点遭到了和硕特部的坚决反对，他们是见识过官军的战斗力的，和硕特部认为同等数量下蒙古人绝对不是官军的对手，一旦没有兵力优势的话，和硕特部宁可不参加和官军的战斗，这使得瓦剌三部极为恼火，没有和硕特部，此战是绝对不好打的，这里已经是和硕特部的住牧地了，和硕特部熟悉当地情况，没有和硕特部的帮助，瓦剌三部不仅仅会面临兵力不足的窘境，同时对于当地的环境也是不熟悉的。
而和硕特部的台吉们认为，要准备各种的装水的器具，驮运饮水，然后以三天时间东进，然后转而北上，占据奎屯河的上游，修整之后和官军决战，对于和硕特部所提出的这个办法，瓦剌三部也还是能够接受的，毕竟和硕特部长期住牧于此地，对于当地的地形、水文等还是比较了解的，同时和硕特部的牧民们也可以为蒙古人提供向导，只要能够有水源，对于蒙古人还是能够作战的。
于是蒙古人在准备之后再和硕特部向导的指引下向奎屯河进发，而李成梁也将尖哨放了出去，不仅仅向西侦察，还要对于奎屯河的上下游予以侦察，重点寻找蒙古大军的踪迹，为官军的下一步的行动提供参考，同时就是摸清楚附近的地形，由于此地地处准噶尔盆地西南部，跨准噶尔盆地和北天山山地两大地貌单元，由北而南随海拔程度的升高，小区域气候由干燥、半干燥向湿润过渡，气候地貌的地带性差异很大。
同时北部的准噶尔盆地主要由冲积平坦平原构成，其中相当部分为半沙漠；中部为盆地到山地的过渡带，由冲积洪积倾斜平原和干燥剥蚀低山构成；南部为北天山山地，由干燥剥蚀中山、侵蚀剥蚀中山和冰缘、冰川作用高山构成。境内天山山地为北天山中段北坡的一部分，包括依连哈比尔尕山西段北坡和婆罗科努山东段北坡。
根据这种地形，李成梁也作出了安排，官军驻守于奎屯河西岸，同时尖哨向奎屯河以北加以侦察，李成梁判断，蒙古人必定不会走南边，因为南方是天山，对于大军行进是极为不利的，北边地形平坦，虽然干燥，但是便于行军，而且蒙古人只要能够抵达奎屯河，就可以获得水源了，所以李成梁的判断是蒙古人应该会从北边来，而官军的战术就是北上迎击蒙古人，绝不让蒙古人接近奎屯河。
所以这几天官军的尖哨活动的异常频繁，而蒙古人也在和官军玩疑兵之计，蒙古人的偏师从西面直扑奎屯，试图吸引官军的注意力，而李成梁根本不为所动，李成梁玩这些的时候，蒙古人还在放羊呢，他仔细计算这蒙古人的脚程，官军在第三天的早上拔营起寨，沿奎屯河北上，同时尖哨也沿奎屯河向西侦察。
最终官军的尖哨在距离奎屯河五十里不到的距离发现了蒙古人，李成梁当即命令麻贵率领轻骑前往拦截，李成梁率领官军主力在后，在发现了官军的尖哨之后，蒙古人也立即加快了速度，蒙古人很清楚，现在蒙古人在没有水源的情况下行军了三天，不管是人员还是牲畜都急需饮水，现在的当务之急就是赶到奎屯河获取水源，否则的话，不用官军动手，蒙古人自己就会溃散了。
而麻贵则是率领官军的轻骑前出拦截蒙古人，不使其接近奎屯河，能够获取水源，而蒙古人当然是加紧赶往奎屯河，李成梁的官军主力则是沿奎屯河一路向西北行军。