朱载坖认为，朝廷直道是朝廷的干线，主要是为了国防和经济服务的，为了节省成本，肯定是不可能照顾到所有的州县的，而地方各级官府，可以动支本省的财政，同时在由朝廷资助一部分资金，修建本省连接各府州县的道路，这些道路的规格可以略低于朝廷的直道，这样的话也可以节省成本，符合实际情况。
然后各省将自己所修建的省内干道连接各府州，而各县则是修建自己的道路连接到本省的干道上来，这样的话对于朝廷的道路实施分级管理，形成朝廷直道，省直省道，府州县县道的三级管理体系，朱载坖同时命令对于直道、省道、县道制定相关的标准，推动大明的道路发展，朝廷和各省直、府州县各司其职，各负其责，这样的话，才能够更好的使得这些花费巨资修筑的道路起到作用。
同时在北方则是要加强京师和山西的联系，修通直道和相关的道路，因为经过遵化铁厂等的实践，山西等地出产的煤矿炼焦之后炼铁的效果最好，同时由于京师人口增加，朝廷又推行减少烧柴，增加煤炭使用的规定，所以京师的附近的煤矿使用量激增，而京师附近的煤矿显然没有山西的煤炭好，而且山西在国防上的有极为重要的作用，所以朱载坖决定要开发山西的煤炭，为朝廷所用。
同时就是加强辽东的交通情况，主要是加强茂山和辽阳、沈阳的联系，茂山铁矿的品质极好，对于发展辽东的煤铁作用是很大的，但是鸭绿江限制了茂山铁矿的外运，朱载坖之前也已经命令辽东等地布政使司仔细查看鸭绿江的水文情况了，鸭绿江长白至临江段，两岸高山连绵，河谷切割较深，河道弯曲，行船困难。临江以下两岸山势逐渐降低，河道坡降变缓，至浑江汇流处，势逐渐宽展，进入中下游，水流分叉、沙洲漫布，到九连城马市台处进人感潮河段。下行至河口的口门列为潮区。
虽然在辽东修建桥梁有很大的难度，但是朱载坖依旧要在鸭绿江上修筑桥梁，一来是便于朝廷守卫茂山等地，同时加强对于朝鲜的控制，将茂山的矿石等运输到辽东冶炼，现在朝廷从河南等地迁移了大量的百姓到辽东、吉林，这些百姓们需要各种物资才能够开垦土地，修建房屋等，所以无论是铁料还是煤炭等物资，对于这些百姓们来说就是极为重要的。
在朱载坖的支持之下，现在的大明，不管是朝廷官营的遵化、辽东、徐州等大型铁业，还是民间的中小型铁冶，发展都是十分之迅速的，尤其是实现了平炉炼铁和反射炉这两个重大的技术突破之后，大明的生铁冶炼能力极大的上升了，铁料和铁器的出口也是大明重要的收入来源，不管是朝鲜还是南洋甚至是西洋人都从大明采购大量的铁料，同时朝廷的钢产量也得以提升，不过相对于铁来说，炼钢的技术进步不大，不过朱载坖也会加强对于这方面的投入的。
朱载坖安排好了这些事情，李成梁的密疏也通过急递的形式送到了朱载坖的案头，朱载坖对于李成梁的小心思自然是很清楚的，李成梁看似粗犷，但是其实内心心思缜密的很，这点朱载坖是很清楚的，李成梁不仅能够打仗，揣摩人心也是一把好手，就像这次，虽然朱载坖已经授权李成梁相机战守了，但是李成梁仍旧要给朱载坖恭恭敬敬的上疏请示，以示自己对朱载坖的尊重，虽然李成梁很清楚，朱载坖一向鲜少干涉前线将帅作战，但是李成梁该走的程序是从来不落的。
朱载坖仔细查看了李成梁的上疏，同时查看了地图，原本朱载坖准备将奏疏给戚继光商量的，但是戚继光从今年年初就一直抱病在家，翰林医官院也诊视过了，情况不是很好，朱载坖也不愿在这个时候多打搅他，影响戚继光养病，所以朱载坖在查阅了李成梁的奏疏之后，召见了三千营总兵李如松。
作为马芳的学生，李如松对于骑兵还是有些本事的，并不逊色于乃父，朱载坖将李成梁的奏疏给李如松，问道：“你怎么看的啊？”
对于自己父亲的这个方略，李如松反而认为过于保守了，李如松认为现在完全可以直插伊犁河谷，进兵叶尔羌，至于吐鲁番，根本不是问题，朝廷的主要目的应该是伊犁河谷，将西域彻底分为南北两个部分，然后先收拾瓦剌，在调转枪口南下收拾叶尔羌汗国等力量。
李成梁的这个方略，今年收复吐鲁番和庭州，明年再收复伊犁河谷，将朝廷在西域的战事时间拉长了，朱载坖听了之后说道：“稳重一点也并非不是好事。”
朱载坖知道李如松是马芳的高徒，一向用兵轻捷，不过现在大明需要的是稳重，朱载坖对于李如松也加以勉励，同时朱载坖要求李如松加强三千营的训练，保证三千营作为朝廷的精骑和快速反应力量，一直保持强大的战斗力，朱载坖批准了李成梁的方略，以急递的形式送达军前。
等到朱载坖的御批抵达哈密的时候，西域已经开始转冷了，西域的秋季很短，冬季严寒，这个时候对于大明官军来说，并不是用兵的良好时机，因为窗口实在是太短了，一旦官军不能迅速拿下吐鲁番的话，就要暴露在严寒中，西域风沙极大，冬季在野外，即便是官军有皮裘等御寒衣物一样也很难作战，将会面临严重的非战斗减员，这点李成梁作为宿将，不可能不清楚的。
但是李成梁斩钉截铁的说道：“圣谕煌煌，岂可违逆？此战有死无生，敢言退却者，本帅必以天子剑斩之！”李成梁堂堂国公，又是朱载坖心腹大将，还有上谕和天子剑，众将也只能听命。