朱载坖严厉的申斥了石星，同时要求兵部和吏部推选合适的人选赴广西任职，以稳定广西的局势，朱载坖很清楚，石星不是能够率兵平叛的人选，徐渭向朱载坖密疏推荐了李化龙，朱载坖也认为李化龙是知兵之臣，同时在贵州处置土司也算是得力，所以朱载坖亲自下旨，任命李化龙为巡抚广西都御史同时加南京兵部左侍郎衔，迅速赶赴广西，将石星调任南京都察院右佥都御史。
同时朱载坖还在积极准备南巡的事宜，准备在天气稍微转暖之后，就和李皇后以及两位贵妃和公主一道南下南京，朱载坖在准备各种南巡的事务，户部已经将隆庆二十年的财政决算报表送到了朱载坖的案头，隆庆二十年财政出现了巨大的赤字。
这点朱载坖是很清楚的，对北虏用兵，同时又要屯垦吉林，同时在国内还有大量的基础设施营建，对于大明来说，今年出现财政赤字是很正常的事情，朱载坖对此也是早有准备，并没有感到意外，朱载坖在收到有关奏疏之后，也召见了相关的臣子，商量朝廷明年的用度问题。
对于出现赤字，朱载坖并不担心，一来是内帑还有部分储蓄，太仓盈余十多年，也还是有部分储蓄的，但是朱载坖真正关心的是各种物资的储备问题，虽然这么多年以来朱载坖很重视农田水利工程的营建，大明也修建了大量的农田水利，但是大明这么大，每年的各种天灾人祸仍旧是不少的，尤其是在西北，干旱是很常见的灾害，朝廷每年都要在赈济上花费不少。
但是朱载坖仍旧认为，赈济是必须的，通过赈济，朝廷能够将百姓安定下来，这点是朱载坖的最为关心的事情，一旦百姓得不到及时的赈济，就容易产生流民，进而产生流寇，这是朱载坖一直在防范的问题，而阁部重臣们则是劝说朱载坖要节省用度，保证朝廷财政相对健康，今年的用度确实是太大了。
户部尚书王国光向朱载坖奏报了，朝廷二十年以来，所储积的盈余不是二千二百余万元，去年一年就超支七百万，而且广西的叛乱要用多少年尚且不知，再这么用下去，朝廷很快就会府库空虚的，这点朱载坖当然是很清楚的，不过现在朝廷很多事情都是做到了一半，不能轻易放弃，朱载坖也对于王国光加以安慰，要求王国光实心用事，好生理财，同时朱载坖也向重臣们保证明年除了讨平广西的叛乱之外，朱载坖不会主动掀起战事的。
朱载坖还命令总督仓场户部尚书兼司农寺卿杨俊民审查朝廷的仓储事宜，朝廷今年大规模用兵，动支了北直隶和京通仓的仓储，朱载坖要求杨俊民要想办法补足仓储，保证朝廷的储备，同时不仅仅是北直隶、河南和京通仓，大明全国的仓储都要进行检查，在河南、陕西、甘肃等灾害频发的地方，还要专门加强仓储，以保障朝廷应对各种天灾的能力。
不过杨俊民也向朱载坖陈述了自己的看法，大明现在虽然建立起来看似比较完备的仓储设施，但是在储备仓库和仓储能力的建设上，朝廷一直是偏重于北方的，朱载坖最关注的就是辽东、河北、河南、陕西、甘肃等省份的仓储，因为这些地方土地贫瘠，粮食产量低，各种水旱灾害也非常之频繁，在这种情况下，朱载坖对于这些省份的物资储备重视也是很正常的，像辽东则是因为朝廷要用兵，同时接下来要开垦吉林等地的土地，朝廷会大规模移民过去，这都是需要粮食支持的，所以朱载坖在此地囤积了大量的粮秣。
但是杨俊民向朱载坖指出，朝廷在南方各省的储备不足，尤其是东南南直和浙江，这里人口稠密，经济发达，但是朝廷并没有建立相应的仓储，而且命令地方官府负责仓储事宜，而地方官府财力毕竟不足，再加上这些地方的粮食价格不低，地方官府一向不愿意多储备粮食，导致朝廷在这些地方的储备不足。
杨俊民认为，现在苏松等地已经不是大明的粮食产区了，相反苏松每年还要依赖湖广等地的所出产的粮食，况且苏松、杭州府等地现在是大明的经济重心，人口众多，工场繁盛，每天都需要大量的粮食，而苏松本地所出产的粮食是远远不足以供应本地日渐繁盛的人口的，况且苏松每年粮食的种植面积都在减少，这就使得苏松、杭州府等地的粮食供应更加紧张。
而朝廷在这里的储备不足，是极为要命的，一旦这里的粮食供应出现问题，粮价飞涨，是很容易的激起民变的，所以朝廷要在东南加强储备，不仅仅是应急之用，还要在平时作为平抑粮价，安定民心之用，杨俊民的话得到了朱载坖的认同，之前朝廷财力不足，而且朱载坖更加担心北方的流民问题，所以朱载坖所建立仓储常平体系重点在北方，尤其是在西北和辽东等地，对于苏松的关注不足，这确实是一个问题。
但是现在朝廷的财政已经有所改善了，对于整个南方，尤其是苏松等地的粮食储备和物价调控确实是要注意了，这点朱载坖也是认同的，苏松等地人口稠密，一旦发生民变可不是开玩笑的，朝廷必须有所准备，朱载坖同意了杨俊民的意见，在南方增加投入，加强储备，以平抑物价。
朱载坖很清楚，明年的财政肯定也会是赤字，大量的工程营建仍在继续，朝廷还要在北方支持吉林和河套的屯垦，在广西平定叛乱，但是朱载坖也给王国光吃了一颗定心丸，朱载坖同意从内帑中调拨一部分钱粮，支应太仓，减轻太仓的负担，但是朱载坖也明确了自己的态度，各项大型工程等，尤其是道路的营建不能停止，吉林等处的屯垦也要加以支持。