朱载坖要求戚继光和李成梁在制定作战计划的时候料敌从宽，尤其是这次官军是在几乎完全陌生的地域作战，可能会遭遇到各种问题，所以必须要料敌从宽才行。
对于朱载坖的这个要求，各位重臣们也认为是合适的，朱载坖最关心的仍旧是后勤辎重的保障，大军在千里之外作战，后勤是最重要的，尤其是李成梁部，又是骑兵作战，要详细制定相应的后勤补给方案，同时要征调相关的各都司兵力，负责保障官军的后勤，同时保障官军的后路。
同时朱载坖还敕令蓟镇和大宁镇准备仓库，修建兵站，提前运输粮秣储存，保证能够接济的上李成梁的大军，而在商量完了这些事情之后，张居正等人奏请朱载坖回宫，最近朱载坖养病，很多事情都是内阁在处理，朝廷上下议论纷纷，现在太子在外，皇帝又有病，朝廷上下人心浮动，所以张居正等人奏请朱载坖回宫，至少能够将朝廷安定下来。
朱载坖原本是不想这么快就回宫的，但是朱载坖考虑到现在又是大庆和征虏，朝廷现在确实需要镇静，还是答应了臣子们请求，决定三日之后回宫，朱载坖重新回宫之后，已经积累了不少的政务要处理，朱载坖只得埋头在政务之中，同时朱载坖命令内官监修缮养心殿，作为自己日后的休息之所，原本养心殿主要为皇帝起居听政之外闲居的宫殿，也是皇帝常常用膳的地方，嘉靖十七年才开始修建，后来世宗皇帝长居西苑，实际上还没有使用过。
朱载坖正是看中了养心殿从未有人居住过这些特性，才决定修葺养心殿，作为自己的日后的休息之所，同时在休整了一段时间之后，朱载坖恢复了状态，继续批答奏疏，至于百官奏请的朝会事宜，朱载坖仍旧不予回复，朱载坖实在是对于朝会没有任何兴趣，除了实在是无法推脱的正旦日大朝会之外，朱载坖一向是不怎么爱举行朝会的，朱载坖也经常召见官员。
不过朱载坖召见的官员起码都是四品以上，对于微末京官，一年只见朱载坖一面那是很正常的事情，虽然这些官员们是多次向朱载坖上疏，请求朱载坖勤御朝讲，但是对于这些奏疏，朱载坖一律当废纸处理，对于朱载坖来说，朝会比上刑还让他痛苦，即便是当了二十年的皇帝，朱载坖还是不能接受所谓的朝会，尤其是朔望朝，对于朱载坖和一些老臣们来说，简直是上刑。
每逢朔望日朝会，早朝之前，大臣必须于午夜起床，准备停当之后，前往午门集合。大约寅时初刻，大臣们到达午门外等候。午门乃是紫禁城的正门，中间为御道，平时不开启，左右两阙则供当值将军和宿卫执杖旗校等人的出入。又在左右两掖各开一门，称为左、右掖门，这才是百官入朝之门。午门上楼名五凤，设立有朝钟朝鼓，由钟鼓司宦官掌管。
一般在卯时初刻，官员们开始进入皇宫。文官由左掖门进入，武官由右掖门进入，先在金水桥之南根据品级排列好次序。鸣鞭之后，依次过桥，到达奉天门丹墀，文官为左班、武官为右班，在御道两侧相向立侯，称为起居。在此期间，有负责纠察的御史在旁监督，凡是有咳嗽、吐痰、拥挤或仪态不整的都会被记录下来，听候处理。
而作为皇帝的朱载坖，起床时间可以比官员们稍微晚一些，但是也不会太晚，因为朱载坖也要准备，在朔望日朝会中，奉天门上廊内正中设御座，称为金台。台阶左右是钟鼓司的乐队，殿陛门楯间列锦衣亲军大汉将军，穿着全服铠甲，御道左右及文武官员身后则各有校尉和府军前卫带刀官握刀站立。
钟鼓司奏乐，皇帝到达御门，锦衣卫力士撑五伞盖、四团扇，从东西两侧登上丹墀，立于御座后左右。内使两人，一人执伞盖，立于座上，另一人执武备，杂二扇，立于座后正中。朱载坖在奉天门升坐之后，再次鸣鞭，鸿胪寺官员唱入班，左右文武两班齐头并进步入御道，此时文官北向西上，武官北向东上，行一拜三叩之礼，是为“大班”。公侯、驸马、伯自成一班，即所谓的勋戚班，居武官班前而稍离。
百官行礼之后，鸿胪寺官员先出班，对皇帝奏报入京谢恩、离京请辞的官员人数。这些人都是前一天在鸿胪寺报备好的。如果皇帝要召见，那么便先行入殿觐见；如果皇帝不见，则在庭下或午门之外遥行五拜三叩之礼，行礼之后便算完事了。
接下来就是宣布边关是否有战事，大者宣露布，小者具奏本，俱于早朝未奏事之先宣布，所以张国威而昭武功也。宣读完这些之后，才开始奏事，每个官员在奏事之前，“皆预咳一声”，此称为“打扫”。在打扫之后，要奏事的官员便迈步出班，到御前跪下奏事，说完之后便重新回到班列。奏事之时不用口语，而是大声朗读奏疏。通政司、鸿胪寺官员除了引导官员们奏事之外，有时还需要代读奏疏，而为了达到“美观瞻”的效果，一般选取该衙门中符合美姿容和大音声标准的官员。
一般在这个环节，什么两广等地的官员就容易直接被淘汰，选取乡音不浓，洪武正韵很标准官员担任，在奏事之后，由御史上奏早朝期间官员失仪情况。至此，早朝流程也就基本完毕了。鸿胪寺官员“唱”奏事毕，鸣鞭驾兴，待圣驾退后，百官亦退，各回衙门莅事。
说实话，这个所谓的朔望大朝会，对于朱载坖来说没有任何的意义，因为真正的大事怎么可能拿到朝会上来说，纯属是露个脸的事情，对于朱载坖来说自然是极为反感的，朱载坖每天处理政务都要到很晚，在起来参加朝会，怕是真的不要命了。