为了这次的征虏，朱载坖是做了充分的准备的，因为朝廷不仅仅是要击败北虏，更重要的是要实际控制松花江以南，这需要大量的人口，尤其是卫所士卒，才能够且耕且屯，将这些土地给控制下来，所以朱载坖从山东、直隶、辽东、大宁等北方卫所中挑选军余子弟和舍人们，鼓励他们移民实边，对于愿意前往松花江以南的，所开垦的土地，五年起科，也就是免税五年。
同时为这些士卒们提供皮袄、胖袄等御寒的衣物，还有棉被等物资，在头三年，朝廷对于所有的卫所军士，都按照脱产军士的标准予以供应，即每人每月一元和米一石，用于这些士卒们养家糊口，在三年之后，朝廷从各卫所抽调组建脱产军士，除了这些之外，朝廷还要保障这些士卒们的种子、农具、耕牛等物资，优先挑选有家有口的军余子弟前往，这样才能够保证朝廷持续的控制这些地方。
还要发给安家费，同时运输各种物资帮助他们在松花江以南安顿下来，按照朱载坖之前和五军都督府所统计的数据，准备在松花江以南设立卫所二十个，着重控制吉林、长春、松原、白城、延吉一线，东制朝鲜，西怀蒙古，南靠辽东，北御土蛮，这就是朝廷对于这些新设立的卫所的定位。
同时将这些女真部落也要置于这些卫所的管理之下，将这些卫所编成一个新的都司，即吉林都指挥使司，同时从辽东镇调遣部分官军充实吉林都司的兵力，朱载坖的想法是在三年内向吉林都司投资五百万，沿松花江建立起大明的防线，还有修筑直道和辽东、大宁等镇相联系。
根据辽东镇的查探，现在松花江南北，土蛮部有精壮部众六万余，还有兀良哈部残部和当地的蛮夷，怎么说也是有十万之数的，朝廷不能等闲视之，而且在处理土蛮之前，朝廷要先处理朝鲜，朝鲜在大明对于辽东无力经略的时候，偷偷摸摸搞了不少的事情，之前大明没工夫搭理他，现在朱载坖自然是要和朝鲜算算总账了。
朱载坖通过驻朝大臣，还有王兀堂等女真部落的控诉，大概得知了朝鲜这百余年来所干的好事，自李成桂起，朝鲜即以恢复高句丽旧疆为夙愿，为此在两江流域拓疆置镇。不过当时是太祖成祖两位雄才大略的帝王，朝鲜人想在他们两位上搞什么花样是想找死了。
而朝鲜人真正将自己的野心付诸于实践是在所谓的世宗大王时代，因为当时大明已经开始收缩了，他们遂在鸭绿江、图们江流域拓展自己的势力，当时的朝鲜大臣毫不隐晦自己的野心，上疏称：“王太祖统合三韩，威不及于朔方，只以铁岭为界。我太祖起于朔方，奄有大东，南尽于海，北抵于豆满，爰置七州。辟国以后，未有之盛业也。第因昇平日久，守臣失御，镜城以北，陷为贼薮。恢复旧疆，是在圣上继述耳。”
朝鲜的所谓世宗大王自己也说过：“自古帝王莫不重兴王之地，以为根本。我国北界豆满江，天造地设，雄藩卫而限封疆，太祖始置庆源府于孔州，太宗移府治于苏多老 ，皆所以重肇基之地也。守官失御，退寓富居。太宗尝有命：若胡人来居，则便行斥逐，勿使为贼窟穴。今夫苏多老、孔州鞠为茂草，胡骑践蹂，恣为游猎之场。予每念此，痛切于怀。咸吉道北门沿江州郡，本我国旧疆，久为野人所据，至是尽复之。”
朝鲜推行所谓的北进战略，就是打击女真人，而大明在这段时间内处于战略收缩的状态，没空管理朝鲜人，使得朝鲜人得以推动自己的北进计划，女真人受屈之后，自然是向大明哭诉，但是这个时候的大明忙于对付北虏，根本没有功夫管这些事情，而且大明之前的政策就是偏袒朝鲜的，即所谓字小之仁，这是从成祖以来的策略。
但是朱载坖显然不是这么看的，朱载坖很早就给朝鲜划定了底线，一是朝鲜不得危害大明在辽东汉地的核心利益，二是朝鲜不许与建州等女真等私行交通。朝鲜对底线一，轻易不加触碰，故无变故。而对底线二，却时常暗地谋划。朝鲜经常有招降女真酋长的举动，这点建州左卫指挥使王兀堂已经多次向朝廷所奏报了，朱载坖认为，之前大明向来厚待袒护朝鲜而打压女真，造成女真对朝鲜、大明的怨恨愈积愈深，这不符合大明的利益，现在大明也要维护自己属夷的利益了。
所以朱载坖之前就对王兀堂下旨，要求他反击朝鲜越境，要是朝鲜兴兵而来，要立即奏报天朝，现在女真和朝鲜的矛盾是比较尖锐的，女真和朝鲜都向大明奏报，声称是对方先挑起冲突，不过朱载坖对此是洞若观火的，真正的原因就是朝鲜不断的欺凌女真所导致的，朝鲜的小动作过多，朝鲜西北两界官将又不能善抚女真，甚至欺凌女真，以致招抚失宜，边衅大开。
而现在的女真，经过大明的多次打击之后，势力大不如前了，所以给了朝鲜可乘之机，朝鲜认为可以借此机会扩展自己的势力范围，朱载坖这次要为女真人主持公道了，朱载坖一面严斥朝鲜，斥责其擅起边衅，欺凌女真，同时重申女真乃是大明的属夷，要是朝鲜再挑事的话，大明就不是严斥了，另一面朱载坖命令提督蓟辽军务黑春和辽东总兵严绍庭与尼堪外兰、王兀堂等女真酋长一旦巡视大明和朝鲜的边境。
查照太祖、成祖时的边界线和现在的边界线相比较，还有就是朝鲜鸭绿江流域所设立的四镇、图们江流域所设立的六镇对于大明的边防是否构成威胁，还是详细情况，尤其是在图们江的六镇，要详加查探，以防对大明构成威胁。