朱载坖对于这些情况并没有立即作出回应，而是在和户部、兵部、练兵军务处还有九边各镇、各都司，商量重新确定开中盐引的数量，随着朝廷大修道路，还有在九边重修开始屯垦，九边的粮食问题比之前要好不少的，士卒的军粮相对有了保障，军储也维持在一个比较高的水平，所以朱载坖命令重新商定开中盐引的数额。
同时还要重新确定盐引和盐税数额。
原内阁首辅、顾问咨询大臣李春芳向朱载坖上疏，作为扬州人，李春芳并没有支持淮盐扩张，李春芳认为淮盐的行盐地域不是太小，而是太多，但是李春芳提出了另外一个问题，就是盐引与盐税的比例问题，作为长期担任内阁辅臣的人，李春芳是很了解大明的财政状况的。
李春芳指出了一个事实，两淮的盐引约占大明全国盐引的三成半，但是所缴纳的盐税数额，却占到了大明盐税的五成半，这说明什么，说明两淮盐运所缴纳的盐税比例畸高，而其他各盐运司所缴纳的盐税比例远远低于两淮盐运司，李春芳指出，这才是问题的关键，朝廷应当关注这个问题，将各盐运司索缴纳的盐税比例高清楚。
李春芳的这个上疏确实是引起了朱载坖的注意，大明的盐税，确实是以两淮运司为主，其余各盐运司，所上缴的盐税比例确实是不足的，朱载坖命令户部查照此事，然后将相关情况报知朱载坖。
除了各地方之间的盐政纠纷之外，兵部、五军都督府、练兵军务处和各都司卫所还有各镇与各盐运司、地方州县的矛盾，因为各处驻扎的官军也是需要大量的食盐。按照大明定例：凡内外大军关支月盐，有家小者，月支二斤；无家小者，月支一斤。
这些朝廷的军士，自然也是要吃盐的，但是和百姓买盐不同，按照道理，官军士卒们的食盐是直接由朝廷运输然后发放给士卒们的，但是现在很多盐运司的盐课早就直接折银了，盐商缴纳盐税之后，直接持盐引到场支盐，盐运司不愿再费时费力的运输本色食盐给各处卫所、官军们，所有很多盐运司采取的办法就是将这些本该实物支给的食盐也折银给了应该领受食盐的卫所。
这让看起来似乎没有问题，但是实际上问题很大，首先就是盐运司支给折色银，是按照盐运司核算的成本价折算成银两给各部官军的，拿到了折色银两的官军发现，盐运司所支给的折色银根本不够买盐的，还不要说各级军官们不得贪墨一些，导致到了士卒们手中，根本不够买盐的，往往因此激起哗变，其中最突出的一件事情就是龙江关争盐。
隆庆元年五月丙辰初，南京应天等五卫军人防守浦子口，其食盐俱赴买于龙江关。已而江浦县李大澜谓浦子口隶本县，令买食盐本县引盐不得越江以启私贩，驻守在南京江浦县浦子口军士认为去地方州县所在地领取食盐很不方便，认为地方州县长官在故意刁难士卒们，于是诸军与州县衙役互相攻击，诸军大噪，击杀部民，大澜仅以身免。
地方州县和卫所士卒们之间因为食盐问题，矛盾激化，其实这就是大明官员们不做人的突出表现，盐运司为了自己省事，将原本应该实物拨给士卒们的食盐折银拨给，但是所折算的银两显然不足以给军士们购买食盐，而对于卫所来说，原本如果按照月支领取食盐，那么要将该支军队的番号以及户部给出的领取食盐的相关证明准备好，并上报朝廷审核后，才能进行下一步。
现在改为折色，肯定是不够购买食盐的，卫所官员们纷纷上疏向朝廷陈述此事，而朝廷为了图省事，继续不当人，户部等有司衙门商量之后，决定将为军队供给食盐的事情交给地方官府，有地方官府负责向卫所提供食盐，但是朝廷是不出一分钱的，全靠地方官府自己去解决。
地方州县的财政本就不富裕，还要额外承担军士们的食盐，如果军士数量不多，地方州县咬咬牙也就认了，但是南北直隶等地方，是朝廷部署重兵的地方，镇协官军、卫所官军林立，就以发生争盐事件的江浦县为例，小小一个江浦县，在他的地盘上有五个卫所，还有操江提督的水师，江浦县根本无力负担，所以只能在南直隶巡抚的介入下，将江浦驻军分散到各地去买盐。
但是士卒们显然不是这么看的，士卒们认为，在特定的地点购买食盐，与府县没有任何关系。龙江关这个地点是专门给卫所军士供给食盐的。但是当时南京江浦知县李大澜则认为南京、应天五卫所驻守的浦子口是本县的管辖范围，不能越江，不然这种行为是买卖私盐的问题。
这孙子也真是瞎了心了，士卒们本来就因为地方官府不支给食盐而心怀愤怒，而龙江关仓中原本就有食盐，但是李大澜不支给军士们，要士卒们买食地方有司引盐，这就属于离了大谱了，军士支盐是天经地义的事情，你不给也就罢了，还整出什么军士应该出银买食地方引盐的幺蛾子，直接激起了哗变。
虽然当时徐阶严厉镇压了哗变的军士，但是军队和地方因为食盐的事情，龃龉不断，这次借由朱载坖整理盐法，兵部、五军都督府、练兵军务处都上疏朱载坖，要求解决军队的食盐问题，事关军队，朱载坖不敢轻忽，当即召集了相关的臣子们，商量此事。
其实兵部等衙门的态度是很简单，就是直接恢复本色食盐供给，这样最简单，朱载坖也认为应当直接恢复本色供给，由兵部会同练兵军务处、五军都督府将各都司、各镇所需的食盐量统计好，由盐运司转运至各都司、镇的治所，然后由各镇、各都司分发下去即可，朱载坖当即命令兵部和户部商量好实施办法之后，条陈上疏，由朱载坖批准后实施。