其实丹羽长秀很清楚徐渭的想法，就是希望北条、越后、甲斐和德川家康、丰臣秀吉拼个你死我活，然后好坐收渔翁之利，这样为大明控制倭国创造机会，丹羽长秀很清楚，此战如果大明获胜，倭国从此将会被大明控制，但是他也很清楚，德川家康、丰臣秀吉这两人固然是倭国中的豪杰，但是面对徐渭，确实还是不够看的。
除了支援北条氏之外，徐渭还要从政治上打击德川家康、丰臣秀吉等人威信，徐渭命令李如松加强京都的守卫，严防德川家康和丰臣秀吉趁机提兵劫夺倭国国王和将军、公卿等重要人物，同时命令倭国国王以丰臣秀吉、德川家康不恭顺为由，向大明安东都护府请求征讨两人，做到师出有名。
同时积极准备相关的战备事宜，准备征讨德川家康和丰臣秀吉两人。
而德川家康和丰臣秀吉两人的动作反而是很快的，隆庆十七年五月初五日，端阳佳节，丰臣秀吉和德川家康的大包围网布置完成。以坚固着称的小田原城和强大的丰臣德川联军之间的持久战开始了。 紧张的状态在两军之间渐渐解除了，持久战期间，双方反而显得十分悠闲。小田原城内，除担当守备者以外，其余休息的人则照常悠游嬉戏，下双陆、开酒宴、举行诗歌会。
而包围军方面的丰臣德川方也一样，由于大量人口聚集，吸引了许多商人和妓女前来谋生。一时间在军营后面开设了许多的商店和妓院。而各家大名则修建起包含书院和茶室的庞大府邸，在庭院里种植树木和蔬菜。丰臣秀吉将其爱妾淀姬接到军中，各大名也将妻子接来，并传来了千利休举行盛大的茶会，各大名互相宴请举行歌舞盛会。但在小田原游山玩水的丰臣秀吉并没有松懈，他派遣别动队四处攻打北条家在关东的支城，意图北条氏在关东的统治基础被摧毁，各个重要防御据点的城池被攻击，松井田城、岩规城、钵形城都遭到丰臣秀吉和德川家康联军的攻击。
不过由于得到了越后和甲斐的援军，北条氏坚守城池，寸土不让，依靠城墙抵御丰臣秀吉和德川家康的进攻，而大明水师的战船也赶来助战，控制了相模湾，为北条和越后、甲斐补充粮秣，这就是使得丰臣秀吉和德川家康有些难受了。
他们两人原本的计划是通过进攻北条氏逼大明官军到他们所预设的战场来来作战，但是没有想到徐渭根本不吃这一套，直接派遣上杉景虎和武田胜赖部的倭国军队与德川家康、丰臣秀吉的联军作战，虽然上杉景虎和武田胜赖的部队没有什么重武器，但是他们从大明官军手中接收了很多官军淘汰的甲胄，然后予以改装，虽然这些甲胄在官军中可能并不适用了，但是毕竟都是铁甲，防护能力肯定比倭军的所谓大铠还是强很多的。
倭国原本的铠甲其材质主要为竹和皮，一般不使用铁材料，虽然造型搞得很厉害，但是纯属屎上雕花的玩意，防护力是远远不足的，不如上杉景胜和武田胜赖手中的官军二手甲胄，而且大明的军官们帮助北条氏加固了小田原城和附近的重要支撑点，储备了大量的滚木礌石和官军不用的老式震天雷，这些装备都给予倭军以沉重杀伤，使得德川家康和丰臣秀吉举步维艰。
而倭国朝廷的命令更是使得德川家康和丰臣秀吉两人如芒在背，虽然现在倭国朝廷没有什么威望，但是大明官军才是他们两人十分忌惮的，在商量了之后，丰臣秀吉和德川家康决定豪赌一把，猛攻小田原城，逼大明官军前来决战。
而在京师的朱载坖也收到了徐渭的加急塘报，朱载坖得知德川家康和丰臣秀吉两人联手之后，极为兴奋，当即御批道：“此辈反相以露，当速调兵马，以正乾坤！”
朱载坖命令加大对于安东都护府的支援力度，为了驰援安东都护府，朱载坖命令工部尚书严世蕃加户部尚书衔与少府卿兼户部左侍郎、北洋通商大臣王直一道负责对于安东都护府的支援，赐天子剑，准允征用民间船只为朝廷转运物资、援兵等，同时再向安东都护府增兵二万，以加强安东都护府的力量，对于徐渭，朱载坖则授予全权，命令徐渭总览军务，统帅大军征讨不臣。
同时朱载坖还批复了倭国国王的上疏，在徐渭的授意上，倭国国王向朱载坖上疏，请求大明官军帮助倭国王室讨平不臣，朱载坖予以批复道：“此则天朝分内事也！着兵部尚书、经略倭国朝鲜事务大臣、安东都护府都护徐渭相机进剿，恭行天讨！”
而在徐渭的奏疏中还特地说明了在我海商李旦暗中支持德川家康的事情，他长期盘踞长崎，通过走私贸易建立起自己的武装船队和海盗集团，想要完全垄断大明、倭国、朝鲜、琉球等地的东海海贸，当第二个王直，这是朱载坖所不能容忍的。
李旦在长崎时，大肆招募流民和倭国浪人，以充实自己的海贼团，尤其是倭国浪人，这些人只会打仗杀人、悍不畏死，用这些浪人为他的走私船队护航，若非这次大明准备征讨德川家康，朝廷还注意不到他，对于这种人，朱载坖当然不会客气，一面晓谕督师南京大学士沈鲤，督促东南官府、海关、水师剿灭李旦的海上力量，决不允许李旦在海上作威作福，颁布赏格，能够擒斩李旦的，给官指挥使，赏银一万。
另一方面命令北洋水师提督陈璘督率水师，封锁倭国，除了大明朝廷和为朝廷运输物资的船只之外，任何其他船只不准接近倭国，违者一律予以击沉。
在严世蕃和王直等人的组织下，朝廷迅速征调各种物资和援兵，通过大连、天津和釜山向安东都护府补充各种物资和调集援兵。