对于徐阶的这些小心思，朱载坖并不揭破，而是开始准备南巡的相关事宜。
当然首先还是对明年南巡期间的一些大事作安排，番薯今年在皇庄种植已经取得成效了，并且积累了一些经验，在北方，皇庄的老农们总结出了一些经验，惊蛰开始育种，清明以后栽植，霜降时收获，朱载坖命令明年除了在皇庄推广之外，在北方诸省都推开。
还有就是马政，现在大明对于辽河河套已经算是稳固控制了，大宁都司下辖各卫在辽河河套开垦土地，经过两年的屯垦，现在大宁都司虽然仍然需要朝廷供给粮食，但是要不了两年，应该可以自给自足了，经驸马都尉李和的奏请，在辽东恢复行太仆寺，重建马政。
李和考察之后，认为辽河河套地势平坦，河流众多，适合放牧马匹，朱载坖随即任命驸马都尉李和为太仆少卿兼辽东行太仆卿，负责辽东马政，同时调拨军户，种植苜蓿等战马所用的草料，还有大宁都司本地所产的大豆等精饲料，足以供应辽东行太仆寺。
而且这次为了选育良驹，所用的种马都是从各军中挑选而来的优良战马，以西域马和辽东本地战马为主，朱载坖要求李和，不但要为官军选育足够数量的优良战马，还要区分挽马和战马，尤其是大体格的挽马，也是要重点选育的对象，不管是拖曳重炮，还是运输辎重，这些体格健壮的挽马都是官军急需的。
除此之外，朱载坖还命令在太仆寺下设兽医学堂，为官军培训兽医，之后不仅是太仆寺下设的各个军马场还有官军之中，也都要配置兽医，用以保证战马健康。
接下来就是道路的修筑，之前朱载坖利用水泥，修整了从天津到京师的道路，新修的道路极大的提高了运输能力，这使得朝廷上的官员和地方的州县官员们都上疏要求兴修道路，但是现在水泥的产量是远远不够。
朱载坖和重臣们商量之后，决定将朝廷的水泥分成两部分，现在大规模的兴修道路显然是不太现实的，但是对于一些地方州县来说，原本不能修桥的地方，有了水泥之后就可以修建桥梁了，这些应该由朝廷调拨水泥，同时由工部派出武功三卫的工匠协助地方州县修造桥梁，改善当地的交通情况。
而现在的道路主要是要满足军事用途，紧着九边供应，下一步就是修整从京师到蓟镇三屯营一直到山海关的道路，改善朝廷对于蓟辽两镇的补给能力，同时从京师到阳和、宣府的道路也要开始兴建了，朱载坖的计划是先将道路以京师为中心，向辽东、山西、河南、直隶、山东的重要州府，加强朝廷对于这些州府的控制，提高官军的机动能力。
还有就是大型仓库的营建，朱载坖命令工部，在京师、天津等地兴建大型仓库，用以储存粮食，主要是从海上来的粮食，朱载坖认为，不仅要在京师储备足够数量的粮食，九边军镇和各省也要兴建仓库，储备粮食，以备不时之需，尤其是北方各省，更要注意粮食的储备，以应对可能出现的灾荒。
这些仓库由户部派遣官员予以管理，巡按御史要随时监察，敢于盗窃这些库粮的，要予以严惩。
剩下的就是军器的生产问题了，遵化铁厂试造的数百支燧发火铳被下发给国子武学和蓟镇官军试用之后，提出了一些建议之后，正式定名为隆庆八年式燧发火铳，朱载坖要求遵化铁厂和文思院配合，首先是研制各种用于制造燧发火铳的机械，实现流水线生产，提高燧发火铳的生产效率。
除此之外还要筹建弹药厂、火药厂，实现武器装备和弹药的标准化生产，这时候收购坏钱所得的铅锡就派上了用场了，这些铅锡就被用来制造燧发火铳的弹丸，朝廷现在已经将铅锡禁榷，这也导致市面上的坏钱减少，朝廷的制钱和银钱也已经开始流通了。
经过一段时间的流通之后，民间对于朝廷的银钱还是能够接受的，比之银两，银两的重量标准，铸造精美，便于携带，现在的问题就是朝廷铸造的一两银钱太多，主要是用于向百官、士卒发放官俸军饷的，但是从民间使用的情况来说，二钱、五钱的小额银钱反而是百姓们最需要的。
朱载坖也下令少府监增加二钱、五钱银钱的铸造量，现在少府的铸钱量也已经提升上来的，每月可以铸造制钱五万贯，各种银钱八十万枚，朝廷的官俸、军饷以及各种开支以及全部改用制钱和银钱了，但是这些大商贾对于朝廷的银钱仍然有所抵制，朱载坖正在令锦衣亲军和东厂密查是哪些大商贾在私下抵制朝廷的制钱，然后予以严惩。
虽然朱载坖明年要南巡，但是该安排的事情还是要安排下去，从明年开始，朝廷对于折色部分的赋税等都要鼓励百姓缴纳银钱和制钱，凡是用制钱和银钱缴纳赋税的免征火耗，同时由少府出面，在北方各省开展杂色银两和银钱的兑换工作，将银钱的流通推广。
朱载坖和户部商议之后，认为用三到五年的时间，彻底禁止金银在民间的流通，用朝廷的银钱取代各种杂色银两，将铸币权重新收归朝廷。
随着时间临近，隆庆八年已经结束了，隆庆九年的正月照例是各种礼仪活动，但是今年朱载坖不准备参加这些冗长乏味的利益活动了，朱载坖以锻炼皇太子为名，令皇太子朱翊釴和定国公徐文壁恭代祭祀，包括祭祀太庙、田地、祖宗、以及天寿山诸陵寝，一律由皇太子和定国公负责，朱载坖则缩在后宫准备南巡。
正月十六日，朱载坖正式发布上谕，昭告天下，奉请皇太后南巡，同时以太子朱翊釴监国，内阁首辅高拱留京辅政。