天启十年(1630)十月七日，登州。
把守庙岛、封堵登州门户的尚可喜的突然叛变完全出人意料，加上登州叛军撤退得快，次日拂晓朱大典派敢死队进城才发现城中叛军已经基本溜光了，城中剩下的是他们带不走的家眷、军器和物资，朱派人大致清点了一下，大致有约价值万两白银的金银器物、十万石左右粮食、一百一十门大小铳炮、可以装备两万人的刀枪衣甲，还有三千余被叛军掳掠来供驱使的妇女仆役。
朱大典做主把金银器物典当变卖，将换来的白银和粮食当作粮饷分给了三军和随军民兵民众，衣甲兵器重新入库，铳炮就当作客军酬劳给了护国军，吴之前慷慨解囊，其他将领对他颇有好感于是没人来争。大批妇女因城陷失节，恐遭本地父老歧视，朱感觉头疼问众将怎么办，吴开先说我遵化驻地缺人手耕种，妇女也能当半个劳力使，不如也交给我带回去，朱自然痛快答应了。
吴开先敢带这么些人回去是有底气的，因为郑国昌已经来信说陈经纶带人打理的土豆取得了丰收，虽然口感一般但真能管饱！遵化秋收粮食供驻军和民众绰绰有余，来年只要有人手还能扩大规模。吴觉得这批妇女真是天赐之物，对遵化的稳定繁荣很有好处，白师爷对此举措也是竖双大拇指赞同。从登州牢房里还救出一批葡萄牙籍教官，有些还是吴在葡军服役时的官长和同僚，吴便做主把他们留在军中照顾，后征得朝廷和本人同意后纳入了大半进入炮队。其余的朱大典代表大明都给与荣职和盘缠礼送回乡，不幸牺牲的都给予了厚葬和抚恤。
兵不血刃收复登州，登莱之乱至此基本完结，朱大典认为这是个可以接受的结果，立即上书朝廷报喜，并以吴开先为首功；本以为有场惨烈巷战的官兵们也都松了一口气；叛军留下的铳炮都运到了炮队，陈大炮乐得是合不拢嘴，觉得这批炮质料、内膛光洁度都是本军中优秀标准，而引门和本军的有差别，不知有什么玄机，到时候要拿给宋方孙莫等人好好研究一下；诸将中只有吴开先感概，后悔没有及时强攻，致使叛军逃窜，有损朝廷威仪。
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叛军上船后，耿仲明当即和尚可喜结为异姓兄弟，约定同生死富贵，又派遣王子登先期北上联系后金。按尚可喜原定计划，叛军将广鹿岛、小长山岛、石城岛和海洋岛的东江军民尽数裹挟上船，谎称是奉朝廷之命迁往内地。在镇江1沿海登陆后，尚耿二人一边弹压少数军民，一边派人向后金报信。
黄台及闻讯大悦，大呼“承天眷佑，彼自来投”，他公开对群臣说尚可喜耿仲明主动投降不费我朝张弓只箭，率士民甲帐，倾心归命，且首建大功，为国家肃清海岛。经讨论后，后金决定将降众五千八百户安置在海城，并备礼欢迎尚耿二人前来谒见。叛军带来的船只，黄歹极并不重视，后被皮岛明军潜入焚毁。
对于尚耿这两条主动上门的狗，后金方面是极尽拉拢之能事，黄决定要做足样子以示后来人。当日黄即下令八贝勒王各出粟四千石，又从国库拿出银两向积粟之家购粮专供降众。又派出贝勒多尔衮、萨哈镰专程去镇江迎接，又拨给两千马匹以供骑乘。次日，将旅顺战役俘获的尚氏族人送往海城，又派大批工匠参照王爷的标准给他们修葺房屋田舍。十月十九日，心情大好的尚可喜耿仲明来到沈阳觐见黄台及，作为对大明朝野发动的一场心理攻势，黄台及率大贝勒代鳝以下各级官员出城十里迎接。欢迎仪式满汉合璧，尚耿二人对黄台及三跪九叩以示认其为君，黄台及对二人行抱见礼，这是后金大贝勒才配拥有的待遇。黄当即授尚可喜耿仲明二人为总兵官职位，赐予麒麟钮银质印章及敕书各一套，定旗号为白皂旗以别八旗，蟒袍、貂裘、战马、骆驼、兵器、帷帐、牛羊等物资一大宗，又将海州大片土地正式赏给二人，并给予二人相当大的内部自治权。
从丧家犬到座上宾，尚耿二人自然是感恩泣零，几次匍匐在地表示要为后金肝脑涂地死而后已。二人拿出了登莱及东江诸岛的海防图要，当即就要率众为黄台及攻取大明土地。黄台及大悦，又表示来日方长，先将部众安顿妥当，将来有的是建功机会。
看到黄台及如此重视降将，前往海州探视问候的后金各级官员自然络绎不绝，尚耿二人府邸一时间引来送往，好不热闹。见来人甚多，尚可喜就让人在院子里砌了座生祠，上面放上努尔哈赤黄台及及各位贝勒的神位。每逢有后金人来，他都会到蒲台上跪好膜拜。等来人被仆人带进客厅，很自然就会看到尚可喜虔诚的模样。后来耿仲明瞅见，立即就把这招学了去，继而二人下属也有样学样，都在家里立了生祠祭拜。至于他们亲族的排位就不得不放在角落吃灰去了。
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历时两月的登莱叛乱至此落下了帷幕。对大明而言，此次叛乱基本摧毁了三方布置策之一方，山东军州国库为之一空，一批忠臣义士为之死难流放，徐光启孙元化寄予厚望的西式新军毁于一旦，叛军对登州、平度和招远地区的野蛮掠夺杀戮也使得当地人丁凋敝，多年难以恢复；对于后金而言，不费吹灰之力一下子得到近一万多生力军的补充，副将级别的大明军官主动来降还有难以估量的心理优势，黄台及的脑筋又开始活络起来。